Protein–RNA interactions for Protein: Q99489

DDO, D-aspartate oxidase, humanhuman

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDOQ99489 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
DDOQ99489 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDOQ99489 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDOQ99489 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDOQ99489 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
DDOQ99489 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDOQ99489 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDOQ99489 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDOQ99489 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDOQ99489 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDOQ99489 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDOQ99489 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDOQ99489 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDOQ99489 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
DDOQ99489 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDOQ99489 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDOQ99489 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDOQ99489 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDOQ99489 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDOQ99489 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
DDOQ99489 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDOQ99489 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
DDOQ99489 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDOQ99489 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDOQ99489 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDOQ99489 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDOQ99489 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
DDOQ99489 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDOQ99489 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDOQ99489 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDOQ99489 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDOQ99489 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
DDOQ99489 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDOQ99489 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDOQ99489 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDOQ99489 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDOQ99489 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDOQ99489 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDOQ99489 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
DDOQ99489 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDOQ99489 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
DDOQ99489 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDOQ99489 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDOQ99489 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDOQ99489 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
DDOQ99489 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDOQ99489 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDOQ99489 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDOQ99489 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDOQ99489 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDOQ99489 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDOQ99489 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDOQ99489 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDOQ99489 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDOQ99489 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDOQ99489 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
DDOQ99489 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDOQ99489 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
DDOQ99489 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDOQ99489 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDOQ99489 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDOQ99489 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.4■■□□□ 1.18
DDOQ99489 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDOQ99489 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
DDOQ99489 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDOQ99489 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC22.39■■□□□ 1.17
DDOQ99489 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDOQ99489 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
DDOQ99489 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDOQ99489 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDOQ99489 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDOQ99489 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDOQ99489 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDOQ99489 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDOQ99489 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDOQ99489 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDOQ99489 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDOQ99489 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDOQ99489 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
DDOQ99489 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDOQ99489 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDOQ99489 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
DDOQ99489 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDOQ99489 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDOQ99489 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDOQ99489 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDOQ99489 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDOQ99489 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDOQ99489 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
DDOQ99489 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDOQ99489 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDOQ99489 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
DDOQ99489 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDOQ99489 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDOQ99489 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDOQ99489 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
DDOQ99489 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
DDOQ99489 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
DDOQ99489 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.16
DDOQ99489 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.1 ms