Protein–RNA interactions for Protein: Q99439

CNN2, Calponin-2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 309 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CNN2Q99439 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
CNN2Q99439 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 TMEM185A-207ENST00000600449 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 RHOQ-201ENST00000238738 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.34■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
CNN2Q99439 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
CNN2Q99439 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
CNN2Q99439 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
CNN2Q99439 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNN2Q99439 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
CNN2Q99439 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNN2Q99439 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNN2Q99439 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNN2Q99439 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNN2Q99439 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
CNN2Q99439 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNN2Q99439 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNN2Q99439 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNN2Q99439 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
CNN2Q99439 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNN2Q99439 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNN2Q99439 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNN2Q99439 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
CNN2Q99439 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
CNN2Q99439 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNN2Q99439 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNN2Q99439 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNN2Q99439 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
CNN2Q99439 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
CNN2Q99439 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
CNN2Q99439 FAM220A-206ENST00000616824 2211 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms