Protein–RNA interactions for Protein: Q96TA2

YME1L1, ATP-dependent zinc metalloprotease YME1L1, humanhuman

Predictions only

Length 773 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
YME1L1Q96TA2 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
YME1L1Q96TA2 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC27.35■■□□□ 1.97
YME1L1Q96TA2 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
YME1L1Q96TA2 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC27.35■■□□□ 1.97
YME1L1Q96TA2 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
YME1L1Q96TA2 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.34■■□□□ 1.97
YME1L1Q96TA2 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC27.34■■□□□ 1.97
YME1L1Q96TA2 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
YME1L1Q96TA2 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
YME1L1Q96TA2 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC27.33■■□□□ 1.97
YME1L1Q96TA2 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.33■■□□□ 1.97
YME1L1Q96TA2 ZNF787-203ENST00000610935 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
YME1L1Q96TA2 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
YME1L1Q96TA2 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
YME1L1Q96TA2 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.32■■□□□ 1.96
YME1L1Q96TA2 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
YME1L1Q96TA2 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
YME1L1Q96TA2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC27.32■■□□□ 1.96
YME1L1Q96TA2 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
YME1L1Q96TA2 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
YME1L1Q96TA2 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
YME1L1Q96TA2 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
YME1L1Q96TA2 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
YME1L1Q96TA2 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
YME1L1Q96TA2 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.3■■□□□ 1.96
YME1L1Q96TA2 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
YME1L1Q96TA2 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
YME1L1Q96TA2 MAFA-201ENST00000333480 2347 ntAPPRIS P1 BASIC27.29■■□□□ 1.96
YME1L1Q96TA2 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC27.29■■□□□ 1.96
YME1L1Q96TA2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
YME1L1Q96TA2 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
YME1L1Q96TA2 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
YME1L1Q96TA2 EMX1-201ENST00000258106 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
YME1L1Q96TA2 TUSC1-201ENST00000358022 2052 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
YME1L1Q96TA2 RASSF8-202ENST00000381352 2320 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
YME1L1Q96TA2 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
YME1L1Q96TA2 FOXD3-201ENST00000371116 2086 ntAPPRIS P1 BASIC27.26■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 KCNK3-202ENST00000620977 1956 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 GXYLT1-201ENST00000280876 1937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 ZBTB7A-202ENST00000601588 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC27.24■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC27.21■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
YME1L1Q96TA2 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC27.18■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 CERS1-201ENST00000429504 2094 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 ADRA1D-201ENST00000379453 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 SHC2-201ENST00000264554 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.16■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 LDB1-202ENST00000425280 2089 ntTSL 5 BASIC27.16■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC27.14■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.14■■□□□ 1.94
YME1L1Q96TA2 GLT8D1-201ENST00000266014 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
YME1L1Q96TA2 TMEM158-201ENST00000503771 1813 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
YME1L1Q96TA2 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 85.8 ms