Protein–RNA interactions for Protein: Q96SJ8

TSPAN18, Tetraspanin-18, humanhuman

Predictions only

Length 248 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSPAN18Q96SJ8 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSPAN18Q96SJ8 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
TSPAN18Q96SJ8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSPAN18Q96SJ8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TSPAN18Q96SJ8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
TSPAN18Q96SJ8 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.18■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 PPP4R4-202ENST00000328839 876 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 FEV-201ENST00000295727 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.14■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
TSPAN18Q96SJ8 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.14■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 FAM149A-201ENST00000227065 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.08■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
TSPAN18Q96SJ8 KIAA2013-202ENST00000376576 2539 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
TSPAN18Q96SJ8 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC27■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
TSPAN18Q96SJ8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 96.2 ms