Protein–RNA interactions for Protein: Q96RR4

CAMKK2, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase kinase 2, humanhuman

Predictions only

Length 588 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAMKK2Q96RR4 TMEM54-201ENST00000329151 871 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CAMKK2Q96RR4 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CAMKK2Q96RR4 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CAMKK2Q96RR4 INO80B-WBP1-202ENST00000452361 2040 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC33.14■■■□□ 2.9
CAMKK2Q96RR4 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CAMKK2Q96RR4 GKAP1-203ENST00000376371 1778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.14■■■□□ 2.9
CAMKK2Q96RR4 QDPR-202ENST00000428702 1278 ntTSL 2 BASIC33.13■■■□□ 2.89
CAMKK2Q96RR4 AL356441.2-201ENST00000443009 864 ntBASIC33.13■■■□□ 2.89
CAMKK2Q96RR4 CAMK2N2-201ENST00000296238 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CAMKK2Q96RR4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC33.12■■■□□ 2.89
CAMKK2Q96RR4 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC33.12■■■□□ 2.89
CAMKK2Q96RR4 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CAMKK2Q96RR4 SNTG2-201ENST00000308624 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.12■■■□□ 2.89
CAMKK2Q96RR4 AC116565.1-201ENST00000610212 2421 ntAPPRIS P1 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CAMKK2Q96RR4 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CAMKK2Q96RR4 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC33.11■■■□□ 2.89
CAMKK2Q96RR4 PRKAR1B-201ENST00000360274 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.11■■■□□ 2.89
CAMKK2Q96RR4 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC33.11■■■□□ 2.89
CAMKK2Q96RR4 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CAMKK2Q96RR4 TMEM218-215ENST00000532407 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.1■■■□□ 2.89
CAMKK2Q96RR4 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC33.1■■■□□ 2.89
CAMKK2Q96RR4 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CAMKK2Q96RR4 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CAMKK2Q96RR4 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CAMKK2Q96RR4 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CAMKK2Q96RR4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC33.09■■■□□ 2.89
CAMKK2Q96RR4 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC33.09■■■□□ 2.89
CAMKK2Q96RR4 SCARA3-202ENST00000337221 1910 ntTSL 1 (best) BASIC33.08■■■□□ 2.89
CAMKK2Q96RR4 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CAMKK2Q96RR4 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC33.08■■■□□ 2.89
CAMKK2Q96RR4 PKNOX2-AS1-201ENST00000532316 586 ntTSL 3 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC33.07■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 YBX1P4-201ENST00000392794 808 ntBASIC33.06■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 AL355490.1-201ENST00000445808 805 ntTSL 3 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 TCEA1-214ENST00000640382 1234 ntTSL 5 BASIC33.06■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.05■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC33.05■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 AL161658.1-201ENST00000623641 1967 ntBASIC33.04■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.04■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 MSX1-201ENST00000382723 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC33.04■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 EVA1B-201ENST00000270824 1054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 ZNF302-211ENST00000509528 577 ntTSL 4 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC33.03■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 KHSRP-213ENST00000619396 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC33.03■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC33.02■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC33.02■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 RDX-206ENST00000528900 1814 ntTSL 1 (best) BASIC33.02■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 UCK1-201ENST00000372208 2063 ntTSL 1 (best) BASIC33.01■■■□□ 2.88
CAMKK2Q96RR4 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC33.01■■■□□ 2.87
CAMKK2Q96RR4 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.01■■■□□ 2.87
CAMKK2Q96RR4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CAMKK2Q96RR4 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33■■■□□ 2.87
CAMKK2Q96RR4 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.99■■■□□ 2.87
CAMKK2Q96RR4 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CAMKK2Q96RR4 PITX3-202ENST00000539804 1187 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CAMKK2Q96RR4 NADK2-202ENST00000381937 2243 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CAMKK2Q96RR4 AC092647.5-201ENST00000426595 1732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.99■■■□□ 2.87
CAMKK2Q96RR4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC32.99■■■□□ 2.87
CAMKK2Q96RR4 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CAMKK2Q96RR4 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.98■■■□□ 2.87
CAMKK2Q96RR4 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.97■■■□□ 2.87
CAMKK2Q96RR4 SLC25A10-203ENST00000545862 1911 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CAMKK2Q96RR4 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CAMKK2Q96RR4 RFLNA-202ENST00000338359 652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CAMKK2Q96RR4 LRP11-202ENST00000367368 1042 ntTSL 2 BASIC32.96■■■□□ 2.87
CAMKK2Q96RR4 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC32.96■■■□□ 2.87
CAMKK2Q96RR4 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CAMKK2Q96RR4 EPM2A-202ENST00000435470 1278 ntTSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.87
CAMKK2Q96RR4 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CAMKK2Q96RR4 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC32.95■■■□□ 2.87
CAMKK2Q96RR4 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.95■■■□□ 2.86
CAMKK2Q96RR4 NTHL1-201ENST00000219066 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CAMKK2Q96RR4 ARL8A-204ENST00000614750 1727 ntTSL 3 BASIC32.94■■■□□ 2.86
CAMKK2Q96RR4 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.94■■■□□ 2.86
CAMKK2Q96RR4 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC32.93■■■□□ 2.86
CAMKK2Q96RR4 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC32.92■■■□□ 2.86
CAMKK2Q96RR4 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CAMKK2Q96RR4 MIR4508-201ENST00000584178 70 ntBASIC32.91■■■□□ 2.86
CAMKK2Q96RR4 TMEM170A-202ENST00000561878 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CAMKK2Q96RR4 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CAMKK2Q96RR4 AL590094.1-201ENST00000635581 706 ntTSL 2 BASIC32.9■■■□□ 2.86
CAMKK2Q96RR4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.9■■■□□ 2.86
CAMKK2Q96RR4 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC32.89■■■□□ 2.86
CAMKK2Q96RR4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.89■■■□□ 2.86
CAMKK2Q96RR4 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC32.89■■■□□ 2.86
CAMKK2Q96RR4 KISS1-201ENST00000367194 709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CAMKK2Q96RR4 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.88■■■□□ 2.85
CAMKK2Q96RR4 FAM173A-202ENST00000564000 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.88■■■□□ 2.85
CAMKK2Q96RR4 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC32.88■■■□□ 2.85
CAMKK2Q96RR4 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC32.88■■■□□ 2.85
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.7 ms