Protein–RNA interactions for Protein: Q96RK1

CITED4, Cbp/p300-interacting transactivator 4, humanhuman

Predictions only

Length 184 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CITED4Q96RK1 INPPL1-201ENST00000298229 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 NEURL4-202ENST00000399464 5200 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 PDE10A-205ENST00000616273 2118 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 USP12-201ENST00000282344 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 COPS6-201ENST00000303904 1432 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 MLST8-203ENST00000397124 1691 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 CARM1-201ENST00000327064 3330 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 HNRNPAB-202ENST00000358344 1796 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 ARRDC1-201ENST00000371421 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 SLC4A3-203ENST00000358055 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC21.21■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.99
CITED4Q96RK1 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 PCYT2-205ENST00000570391 1857 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 NKX3-2-201ENST00000382438 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 FBXO2-201ENST00000354287 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 LINC01578-204ENST00000554894 556 ntTSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.19■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC21.19■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 PEX5-205ENST00000420616 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 FAM83D-202ENST00000619850 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 PPP1CC-202ENST00000340766 1472 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 HOXB3-210ENST00000489475 1845 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 RYK-208ENST00000620660 2942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 RYK-209ENST00000623711 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
CITED4Q96RK1 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 LY6K-203ENST00000519387 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.14■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 NPAS3-210ENST00000551492 2817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC21.13■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.11■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC21.11■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 P2RX5-201ENST00000225328 2309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 MRGBP-201ENST00000370487 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 MPST-201ENST00000341116 1504 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 AL360182.2-201ENST00000451656 470 ntTSL 3 BASIC21.08■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
CITED4Q96RK1 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.1 ms