Protein–RNA interactions for Protein: Q96Q35

ALS2CR12, Amyotrophic lateral sclerosis 2 chromosomal region candidate gene 12 protein, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALS2CR12Q96Q35 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.72■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC26.71■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.87
ALS2CR12Q96Q35 ZFAND2B-204ENST00000409217 886 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 MZT2B-202ENST00000409255 769 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.68■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC26.67■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 GSC2-201ENST00000086933 1033 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.65■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC26.64■■□□□ 1.86
ALS2CR12Q96Q35 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC26.64■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC26.63■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC26.62■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC26.62■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC26.61■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC26.61■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 AL133346.1-201ENST00000435287 495 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.6■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 H2AFV-205ENST00000381124 628 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 PDCD2-215ENST00000614056 1287 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
ALS2CR12Q96Q35 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 TARBP1-201ENST00000040877 5130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
ALS2CR12Q96Q35 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALS2CR12Q96Q35 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALS2CR12Q96Q35 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
ALS2CR12Q96Q35 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 95.3 ms