Protein–RNA interactions for Protein: Q96PQ0

SORCS2, VPS10 domain-containing receptor SorCS2, humanhuman

Predictions only

Length 1,159 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SORCS2Q96PQ0 AL118558.1-203ENST00000553701 447 ntTSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 CR559946.2-201ENST00000623684 991 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 KRT18-201ENST00000388835 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
SORCS2Q96PQ0 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC22.19■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 HNRNPAB-204ENST00000504898 1785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 SMDT1-201ENST00000331479 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
SORCS2Q96PQ0 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 FAM189B-210ENST00000621094 1335 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
SORCS2Q96PQ0 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms