Protein–RNA interactions for Protein: Q96PE3

INPP4A, Type I inositol 3,4-bisphosphate 4-phosphatase, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 977 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
INPP4AQ96PE3 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC28.7■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC28.69■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC28.67■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.67■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
INPP4AQ96PE3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC28.63■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC28.61■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC28.61■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
INPP4AQ96PE3 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC28.55■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 MTCH1-202ENST00000373627 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.54■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.53■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 SPATA5L1-208ENST00000638607 1863 ntTSL 2 BASIC28.53■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
INPP4AQ96PE3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC28.51■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.49■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC28.47■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.47■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC28.46■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 SLC30A10-202ENST00000366926 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
INPP4AQ96PE3 RBPMS-209ENST00000520161 842 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.45■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC28.44■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC28.43■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 PXMP2-201ENST00000317479 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
INPP4AQ96PE3 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 78.7 ms