Protein–RNA interactions for Protein: Q96NG5

ZNF558, Zinc finger protein 558, humanhuman

Predictions only

Length 402 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF558Q96NG5 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF558Q96NG5 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF558Q96NG5 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF558Q96NG5 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF558Q96NG5 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF558Q96NG5 NRG3-203ENST00000404547 2163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF558Q96NG5 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF558Q96NG5 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF558Q96NG5 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF558Q96NG5 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF558Q96NG5 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF558Q96NG5 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF558Q96NG5 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF558Q96NG5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF558Q96NG5 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF558Q96NG5 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF558Q96NG5 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF558Q96NG5 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 UBP1-201ENST00000283628 2074 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 DPF1-204ENST00000416611 2341 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 TSPAN33-201ENST00000486685 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
ZNF558Q96NG5 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 COL13A1-210ENST00000517713 2007 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 PHF23-201ENST00000320316 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 CERS2-201ENST00000271688 2544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
ZNF558Q96NG5 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF558Q96NG5 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF558Q96NG5 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF558Q96NG5 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF558Q96NG5 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF558Q96NG5 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.9
ZNF558Q96NG5 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF558Q96NG5 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
ZNF558Q96NG5 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF558Q96NG5 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
ZNF558Q96NG5 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF558Q96NG5 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF558Q96NG5 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF558Q96NG5 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF558Q96NG5 CCDC88C-205ENST00000553403 1651 ntTSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
ZNF558Q96NG5 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF558Q96NG5 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF558Q96NG5 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC26.9■■□□□ 1.9
ZNF558Q96NG5 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF558Q96NG5 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF558Q96NG5 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF558Q96NG5 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC26.89■■□□□ 1.9
ZNF558Q96NG5 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.88■■□□□ 1.89
ZNF558Q96NG5 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.7 ms