Protein–RNA interactions for Protein: Q96N58

ZNF578, Zinc finger protein 578, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 590 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF578Q96N58 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 CUEDC1-201ENST00000360238 2193 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 AMZ2-201ENST00000359783 1722 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ZNF578Q96N58 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 AC138207.2-201ENST00000583377 492 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 C1orf232-201ENST00000634842 643 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.25■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 KLF16-204ENST00000617223 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 AC139426.1-201ENST00000568218 2529 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 YAP1-204ENST00000526343 2393 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 SIRT3-201ENST00000382743 2543 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
ZNF578Q96N58 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF578Q96N58 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ZNF578Q96N58 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF578Q96N58 TNFRSF12A-201ENST00000326577 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF578Q96N58 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF578Q96N58 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF578Q96N58 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF578Q96N58 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
ZNF578Q96N58 MATK-201ENST00000310132 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF578Q96N58 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF578Q96N58 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF578Q96N58 RTN2-201ENST00000245923 2293 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ZNF578Q96N58 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF578Q96N58 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF578Q96N58 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF578Q96N58 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF578Q96N58 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ZNF578Q96N58 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF578Q96N58 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF578Q96N58 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
ZNF578Q96N58 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF578Q96N58 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF578Q96N58 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ZNF578Q96N58 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.46
ZNF578Q96N58 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 AGAP1-202ENST00000336665 5427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
ZNF578Q96N58 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.1 ms