Protein–RNA interactions for Protein: Q96MX0

CMTM3, CKLF-like MARVEL transmembrane domain-containing protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CMTM3Q96MX0 LINC01578-207ENST00000556895 802 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
CMTM3Q96MX0 AC079305.1-201ENST00000428541 499 ntTSL 3 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 AC234582.1-201ENST00000447623 923 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 ATRAID-201ENST00000380171 1240 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 RHOC-208ENST00000369642 1355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 ARTN-211ENST00000498139 1303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 HRH3-201ENST00000317393 1419 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 ATPAF1-201ENST00000329231 1241 ntTSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.05
CMTM3Q96MX0 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 MAP6D1-202ENST00000431348 890 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
CMTM3Q96MX0 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC21.52■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 SRP68-202ENST00000539137 2386 ntTSL 2 BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 ARTN-201ENST00000372354 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 FOXF2-201ENST00000259806 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
CMTM3Q96MX0 AL355297.4-201ENST00000603191 1249 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 668.7 ms