Protein–RNA interactions for Protein: Q96MN9

ZNF488, Zinc finger protein 488, humanhuman

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF488Q96MN9 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
ZNF488Q96MN9 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 RCOR3-202ENST00000367006 2525 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC21.28■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC21.27■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
ZNF488Q96MN9 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 CCKBR-201ENST00000334619 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 AHSA2-201ENST00000357022 2437 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 SNTB1-202ENST00000517992 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 MRAP2-201ENST00000257776 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC21.21■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 KCNJ4-201ENST00000303592 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
ZNF488Q96MN9 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 NAPA-201ENST00000263354 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC21.2■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
ZNF488Q96MN9 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 773.5 ms