Protein–RNA interactions for Protein: Q96LM1

LINC00615, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00615, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 132 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00615Q96LM1 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 NFYB-205ENST00000551727 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.78■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
LINC00615Q96LM1 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 WSB2-201ENST00000315436 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 AC142086.6-201ENST00000621154 1765 ntBASIC24.75■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 PXDC1-202ENST00000380283 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
LINC00615Q96LM1 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC24.67■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC24.66■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC24.64■■□□□ 1.54
LINC00615Q96LM1 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
LINC00615Q96LM1 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 57.5 ms