Protein–RNA interactions for Protein: Q96KX2

CAPZA3, F-actin-capping protein subunit alpha-3, humanhuman

Predictions only

Length 299 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPZA3Q96KX2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPZA3Q96KX2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
CAPZA3Q96KX2 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPZA3Q96KX2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
CAPZA3Q96KX2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPZA3Q96KX2 TPGS1-201ENST00000359315 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPZA3Q96KX2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPZA3Q96KX2 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPZA3Q96KX2 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
CAPZA3Q96KX2 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPZA3Q96KX2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPZA3Q96KX2 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC26.54■■□□□ 1.84
CAPZA3Q96KX2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPZA3Q96KX2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
CAPZA3Q96KX2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPZA3Q96KX2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC26.52■■□□□ 1.84
CAPZA3Q96KX2 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPZA3Q96KX2 CBX4-202ENST00000448310 718 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPZA3Q96KX2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPZA3Q96KX2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
CAPZA3Q96KX2 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPZA3Q96KX2 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPZA3Q96KX2 AC068152.1-210ENST00000574741 836 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPZA3Q96KX2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
CAPZA3Q96KX2 AL391121.1-201ENST00000607967 1349 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPZA3Q96KX2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPZA3Q96KX2 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
CAPZA3Q96KX2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPZA3Q96KX2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPZA3Q96KX2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPZA3Q96KX2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPZA3Q96KX2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPZA3Q96KX2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPZA3Q96KX2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPZA3Q96KX2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC26.48■■□□□ 1.83
CAPZA3Q96KX2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPZA3Q96KX2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
CAPZA3Q96KX2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.83
CAPZA3Q96KX2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.83
CAPZA3Q96KX2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
CAPZA3Q96KX2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
CAPZA3Q96KX2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.6 ms