Protein–RNA interactions for Protein: Q96KT6

LINC00208, Putative uncharacterized protein encoded by LINC00208, humanhuman

Predictions only

Length 92 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LINC00208Q96KT6 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 FGFR1-214ENST00000447712 5900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.36□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 GIPC1-202ENST00000393028 1483 ntTSL 3 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC14.35□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.34□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.11
LINC00208Q96KT6 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 CD151-202ENST00000397420 1648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.33□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 FAM89A-201ENST00000366654 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 KDM2A-202ENST00000398645 6511 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 FLT1-209ENST00000639477 6337 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 MGEA5-205ENST00000439817 5043 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 HIRA-202ENST00000340170 3395 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 HES7-202ENST00000541682 1674 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 CTNND2-201ENST00000304623 5481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 FMR1-208ENST00000440235 4271 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 ROCK2-202ENST00000315872 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 KCTD17-209ENST00000610767 1502 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 MTURN-201ENST00000324453 5937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 CDC42BPB-201ENST00000361246 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 KAT2B-201ENST00000263754 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
LINC00208Q96KT6 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 AFDN-202ENST00000351017 5823 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 EMILIN2-201ENST00000254528 5910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 CNNM4-201ENST00000377075 4800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 ING1-201ENST00000333219 5119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 FGF2-201ENST00000264498 6775 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 ANKRD65-203ENST00000454272 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 CHST14-202ENST00000559991 1968 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 CHCHD4-202ENST00000396914 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 FGFR1-241ENST00000619564 5482 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 ZNF746-203ENST00000461958 5051 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 LZTS3-201ENST00000329152 5257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 FUT4-201ENST00000358752 6059 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
LINC00208Q96KT6 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms