Protein–RNA interactions for Protein: Q96KD3

FAM71F1, Protein FAM71F1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 344 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM71F1Q96KD3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 RP9P-201ENST00000381639 1303 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
FAM71F1Q96KD3 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 RUNDC3A-201ENST00000225441 1821 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.85■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 NKPD1-202ENST00000589776 1950 ntAPPRIS P1 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 AKAP8L-208ENST00000595465 1933 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
FAM71F1Q96KD3 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 AC104109.3-201ENST00000519718 483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 ZDHHC16-204ENST00000370842 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 HSPB11-201ENST00000194214 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 RRNAD1-201ENST00000368216 2254 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC21.78■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 KIAA1456-206ENST00000528753 2392 ntTSL 2 BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
FAM71F1Q96KD3 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 DUX4L29-201ENST00000425409 679 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 LMO2-201ENST00000257818 2294 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 DHRS13-201ENST00000378895 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 NXNL1-201ENST00000301944 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
FAM71F1Q96KD3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM71F1Q96KD3 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM71F1Q96KD3 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM71F1Q96KD3 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
FAM71F1Q96KD3 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 72.7 ms