Protein–RNA interactions for Protein: Q96JY6

PDLIM2, PDZ and LIM domain protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDLIM2Q96JY6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 ATAD3B-201ENST00000308647 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC28.09■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC28.08■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
PDLIM2Q96JY6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDLIM2Q96JY6 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDLIM2Q96JY6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDLIM2Q96JY6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
PDLIM2Q96JY6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDLIM2Q96JY6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDLIM2Q96JY6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDLIM2Q96JY6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
PDLIM2Q96JY6 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDLIM2Q96JY6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDLIM2Q96JY6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC28.05■■■□□ 2.08
PDLIM2Q96JY6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDLIM2Q96JY6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDLIM2Q96JY6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
PDLIM2Q96JY6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDLIM2Q96JY6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PDLIM2Q96JY6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
PDLIM2Q96JY6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
PDLIM2Q96JY6 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDLIM2Q96JY6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.02■■■□□ 2.08
PDLIM2Q96JY6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDLIM2Q96JY6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDLIM2Q96JY6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDLIM2Q96JY6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
PDLIM2Q96JY6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28■■■□□ 2.07
PDLIM2Q96JY6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDLIM2Q96JY6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
PDLIM2Q96JY6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC27.98■■■□□ 2.07
PDLIM2Q96JY6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDLIM2Q96JY6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDLIM2Q96JY6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PDLIM2Q96JY6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDLIM2Q96JY6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PDLIM2Q96JY6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDLIM2Q96JY6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDLIM2Q96JY6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PDLIM2Q96JY6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PDLIM2Q96JY6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDLIM2Q96JY6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PDLIM2Q96JY6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDLIM2Q96JY6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDLIM2Q96JY6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PDLIM2Q96JY6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDLIM2Q96JY6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDLIM2Q96JY6 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDLIM2Q96JY6 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PDLIM2Q96JY6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDLIM2Q96JY6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDLIM2Q96JY6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDLIM2Q96JY6 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PDLIM2Q96JY6 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PDLIM2Q96JY6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDLIM2Q96JY6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDLIM2Q96JY6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDLIM2Q96JY6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PDLIM2Q96JY6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDLIM2Q96JY6 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PDLIM2Q96JY6 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDLIM2Q96JY6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDLIM2Q96JY6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PDLIM2Q96JY6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDLIM2Q96JY6 FAAP20-204ENST00000400919 1413 ntTSL 3 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDLIM2Q96JY6 DRAM2-211ENST00000539140 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PDLIM2Q96JY6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDLIM2Q96JY6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDLIM2Q96JY6 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDLIM2Q96JY6 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDLIM2Q96JY6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PDLIM2Q96JY6 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDLIM2Q96JY6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDLIM2Q96JY6 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PDLIM2Q96JY6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDLIM2Q96JY6 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDLIM2Q96JY6 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PDLIM2Q96JY6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PDLIM2Q96JY6 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDLIM2Q96JY6 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDLIM2Q96JY6 PRELID2-202ENST00000394450 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDLIM2Q96JY6 TMEM125-202ENST00000439858 1786 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDLIM2Q96JY6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PDLIM2Q96JY6 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDLIM2Q96JY6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDLIM2Q96JY6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PDLIM2Q96JY6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDLIM2Q96JY6 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDLIM2Q96JY6 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PDLIM2Q96JY6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDLIM2Q96JY6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDLIM2Q96JY6 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDLIM2Q96JY6 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PDLIM2Q96JY6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.79■■■□□ 2.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 59.1 ms