Protein–RNA interactions for Protein: Q96JN2

CCDC136, Coiled-coil domain-containing protein 136, humanhuman

Predictions only

Length 1,154 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC136Q96JN2 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC136Q96JN2 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC136Q96JN2 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC136Q96JN2 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.06■■■□□ 2.72
CCDC136Q96JN2 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC136Q96JN2 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC136Q96JN2 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC136Q96JN2 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC136Q96JN2 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC136Q96JN2 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC136Q96JN2 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.05■■■□□ 2.72
CCDC136Q96JN2 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC136Q96JN2 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC136Q96JN2 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC136Q96JN2 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC32.03■■■□□ 2.72
CCDC136Q96JN2 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC136Q96JN2 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC136Q96JN2 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC136Q96JN2 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC32.02■■■□□ 2.72
CCDC136Q96JN2 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC136Q96JN2 LFNG-203ENST00000359574 1377 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC136Q96JN2 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.01■■■□□ 2.71
CCDC136Q96JN2 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC136Q96JN2 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC32■■■□□ 2.71
CCDC136Q96JN2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC136Q96JN2 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC136Q96JN2 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC136Q96JN2 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC31.99■■■□□ 2.71
CCDC136Q96JN2 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC136Q96JN2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC136Q96JN2 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC136Q96JN2 CAHM-201ENST00000604200 896 ntBASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC136Q96JN2 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC136Q96JN2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.98■■■□□ 2.71
CCDC136Q96JN2 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC136Q96JN2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC136Q96JN2 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC136Q96JN2 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC136Q96JN2 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC31.97■■■□□ 2.71
CCDC136Q96JN2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC136Q96JN2 FGF3-201ENST00000334134 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC136Q96JN2 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC31.96■■■□□ 2.71
CCDC136Q96JN2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC31.95■■■□□ 2.71
CCDC136Q96JN2 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC31.95■■■□□ 2.7
CCDC136Q96JN2 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC136Q96JN2 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC31.94■■■□□ 2.7
CCDC136Q96JN2 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC136Q96JN2 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC136Q96JN2 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC136Q96JN2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.93■■■□□ 2.7
CCDC136Q96JN2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC136Q96JN2 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC136Q96JN2 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.92■■■□□ 2.7
CCDC136Q96JN2 DUSP15-202ENST00000339738 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC136Q96JN2 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC136Q96JN2 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC136Q96JN2 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC136Q96JN2 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC31.91■■■□□ 2.7
CCDC136Q96JN2 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC136Q96JN2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC136Q96JN2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC136Q96JN2 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC31.9■■■□□ 2.7
CCDC136Q96JN2 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.89■■■□□ 2.7
CCDC136Q96JN2 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC136Q96JN2 AC006486.1-201ENST00000594664 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC136Q96JN2 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.88■■■□□ 2.69
CCDC136Q96JN2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC136Q96JN2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC136Q96JN2 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC136Q96JN2 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC136Q96JN2 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.87■■■□□ 2.69
CCDC136Q96JN2 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CCDC136Q96JN2 LRRC75B-201ENST00000318753 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CCDC136Q96JN2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC31.86■■■□□ 2.69
CCDC136Q96JN2 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC31.86■■■□□ 2.69
CCDC136Q96JN2 NADK2-210ENST00000514504 1233 ntTSL 5 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC136Q96JN2 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC31.85■■■□□ 2.69
CCDC136Q96JN2 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC136Q96JN2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC136Q96JN2 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC136Q96JN2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC136Q96JN2 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC31.83■■■□□ 2.69
CCDC136Q96JN2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC31.82■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC31.81■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC31.8■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC31.79■■■□□ 2.68
CCDC136Q96JN2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC31.79■■■□□ 2.68
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.8 ms