Protein–RNA interactions for Protein: Q96HL8

SH3YL1, SH3 domain-containing YSC84-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 342 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SH3YL1Q96HL8 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3YL1Q96HL8 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3YL1Q96HL8 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
SH3YL1Q96HL8 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 ABL2-203ENST00000392043 2140 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 OXSR1-203ENST00000446845 1908 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 RPUSD1-207ENST00000565809 1918 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 SLC35A1-203ENST00000369557 1653 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
SH3YL1Q96HL8 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 ABHD17AP4-201ENST00000411545 909 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 ZNRF2P2-203ENST00000454624 420 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 UBALD1-202ENST00000587615 799 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
SH3YL1Q96HL8 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
SH3YL1Q96HL8 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3YL1Q96HL8 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3YL1Q96HL8 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
SH3YL1Q96HL8 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3YL1Q96HL8 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3YL1Q96HL8 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3YL1Q96HL8 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
SH3YL1Q96HL8 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3YL1Q96HL8 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3YL1Q96HL8 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
SH3YL1Q96HL8 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3YL1Q96HL8 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3YL1Q96HL8 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3YL1Q96HL8 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
SH3YL1Q96HL8 FOXA3-201ENST00000302177 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3YL1Q96HL8 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
SH3YL1Q96HL8 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3YL1Q96HL8 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3YL1Q96HL8 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3YL1Q96HL8 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3YL1Q96HL8 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3YL1Q96HL8 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3YL1Q96HL8 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
SH3YL1Q96HL8 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3YL1Q96HL8 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3YL1Q96HL8 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3YL1Q96HL8 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
SH3YL1Q96HL8 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.7 ms