Protein–RNA interactions for Protein: Q96GW7

BCAN, Brevican core protein, humanhuman

Predictions only

Length 911 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BCANQ96GW7 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.61■■■■□ 3.45
BCANQ96GW7 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC36.61■■■■□ 3.45
BCANQ96GW7 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC36.6■■■■□ 3.45
BCANQ96GW7 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC36.6■■■■□ 3.45
BCANQ96GW7 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC36.6■■■■□ 3.45
BCANQ96GW7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.6■■■■□ 3.45
BCANQ96GW7 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.59■■■■□ 3.45
BCANQ96GW7 KRTAP5-5-201ENST00000399676 933 ntAPPRIS P1 BASIC36.59■■■■□ 3.45
BCANQ96GW7 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC36.59■■■■□ 3.45
BCANQ96GW7 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC36.59■■■■□ 3.45
BCANQ96GW7 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC36.58■■■■□ 3.45
BCANQ96GW7 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
BCANQ96GW7 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.58■■■■□ 3.45
BCANQ96GW7 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
BCANQ96GW7 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC36.57■■■■□ 3.44
BCANQ96GW7 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
BCANQ96GW7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.57■■■■□ 3.44
BCANQ96GW7 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
BCANQ96GW7 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC36.56■■■■□ 3.44
BCANQ96GW7 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
BCANQ96GW7 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
BCANQ96GW7 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC36.55■■■■□ 3.44
BCANQ96GW7 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC36.55■■■■□ 3.44
BCANQ96GW7 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
BCANQ96GW7 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC36.55■■■■□ 3.44
BCANQ96GW7 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
BCANQ96GW7 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC36.54■■■■□ 3.44
BCANQ96GW7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
BCANQ96GW7 PROSER2-202ENST00000379200 1232 ntAPPRIS ALT2 BASIC36.54■■■■□ 3.44
BCANQ96GW7 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC36.54■■■■□ 3.44
BCANQ96GW7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
BCANQ96GW7 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC36.53■■■■□ 3.44
BCANQ96GW7 ABL1-201ENST00000318560 5766 ntTSL 1 (best) BASIC36.52■■■■□ 3.44
BCANQ96GW7 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC36.5■■■■□ 3.43
BCANQ96GW7 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC36.5■■■■□ 3.43
BCANQ96GW7 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC36.5■■■■□ 3.43
BCANQ96GW7 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
BCANQ96GW7 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC36.49■■■■□ 3.43
BCANQ96GW7 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC36.49■■■■□ 3.43
BCANQ96GW7 SSTR5-201ENST00000293897 1362 ntAPPRIS P1 BASIC36.49■■■■□ 3.43
BCANQ96GW7 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.48■■■■□ 3.43
BCANQ96GW7 CCZ1B-215ENST00000626257 2211 ntTSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
BCANQ96GW7 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.47■■■■□ 3.43
BCANQ96GW7 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
BCANQ96GW7 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC36.47■■■■□ 3.43
BCANQ96GW7 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
BCANQ96GW7 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.46■■■■□ 3.43
BCANQ96GW7 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.43
BCANQ96GW7 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.45■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.44■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.44■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.43■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC36.43■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC36.43■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC36.42■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.42■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC36.41■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 FTCD-204ENST00000397748 1955 ntTSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.41■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 SERP2-201ENST00000379179 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 AL035685.1-201ENST00000636663 812 ntBASIC36.4■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.4■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 MAPK9-202ENST00000347470 1509 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC36.39■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC36.39■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 RNF130-205ENST00000521389 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.39■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC36.39■■■■□ 3.42
BCANQ96GW7 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC36.38■■■■□ 3.41
BCANQ96GW7 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
BCANQ96GW7 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
BCANQ96GW7 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.38■■■■□ 3.41
BCANQ96GW7 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC36.37■■■■□ 3.41
BCANQ96GW7 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.37■■■■□ 3.41
BCANQ96GW7 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC36.36■■■■□ 3.41
BCANQ96GW7 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.36■■■■□ 3.41
BCANQ96GW7 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC36.35■■■■□ 3.41
BCANQ96GW7 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC36.35■■■■□ 3.41
BCANQ96GW7 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
BCANQ96GW7 AL451085.2-201ENST00000605085 799 ntBASIC36.34■■■■□ 3.41
BCANQ96GW7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC36.34■■■■□ 3.41
BCANQ96GW7 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC36.34■■■■□ 3.41
BCANQ96GW7 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
BCANQ96GW7 AC016910.1-201ENST00000422799 1046 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
BCANQ96GW7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC36.33■■■■□ 3.41
BCANQ96GW7 PQLC1-203ENST00000397778 2555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.41
BCANQ96GW7 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC36.32■■■■□ 3.4
BCANQ96GW7 FGFRL1-205ENST00000510644 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
BCANQ96GW7 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.32■■■■□ 3.4
BCANQ96GW7 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
BCANQ96GW7 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
BCANQ96GW7 ANKRD13D-211ENST00000511455 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
BCANQ96GW7 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC36.31■■■■□ 3.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.6 ms