Protein–RNA interactions for Protein: Q96GF1

RNF185, E3 ubiquitin-protein ligase RNF185, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF185Q96GF1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF185Q96GF1 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF185Q96GF1 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF185Q96GF1 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF185Q96GF1 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RNF185Q96GF1 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF185Q96GF1 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF185Q96GF1 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF185Q96GF1 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF185Q96GF1 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF185Q96GF1 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF185Q96GF1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RNF185Q96GF1 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF185Q96GF1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF185Q96GF1 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF185Q96GF1 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF185Q96GF1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF185Q96GF1 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF185Q96GF1 COMMD3-201ENST00000376836 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RNF185Q96GF1 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 HOXD-AS2-202ENST00000440016 999 ntTSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 NRGN-202ENST00000412681 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
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RNF185Q96GF1 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 NRTN-201ENST00000303212 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 CCNYL1-205ENST00000420822 952 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
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RNF185Q96GF1 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
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RNF185Q96GF1 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
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RNF185Q96GF1 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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RNF185Q96GF1 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
RNF185Q96GF1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
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RNF185Q96GF1 RFWD2-201ENST00000308769 2124 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
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RNF185Q96GF1 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF185Q96GF1 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF185Q96GF1 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF185Q96GF1 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF185Q96GF1 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
RNF185Q96GF1 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
RNF185Q96GF1 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
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RNF185Q96GF1 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF185Q96GF1 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF185Q96GF1 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF185Q96GF1 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF185Q96GF1 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF185Q96GF1 CDK2AP1-203ENST00000535979 1281 ntTSL 3 BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF185Q96GF1 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
RNF185Q96GF1 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF185Q96GF1 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.49
RNF185Q96GF1 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.08■□□□□ 0.48
RNF185Q96GF1 ARMC10-202ENST00000323716 2635 ntTSL 1 (best) BASIC18.07■□□□□ 0.48
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