Protein–RNA interactions for Protein: Q96G25

MED8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, humanhuman

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MED8Q96G25 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC24.71■■□□□ 1.55
MED8Q96G25 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
MED8Q96G25 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.55
MED8Q96G25 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.7■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.69■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC24.68■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
MED8Q96G25 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 CAPNS1-201ENST00000246533 1918 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MED8Q96G25 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC24.58■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MED8Q96G25 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
MED8Q96G25 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms