Protein–RNA interactions for Protein: Q96FS4

SIPA1, Signal-induced proliferation-associated protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIPA1Q96FS4 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIPA1Q96FS4 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIPA1Q96FS4 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
SIPA1Q96FS4 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
SIPA1Q96FS4 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC25.38■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC25.34■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 AMN-201ENST00000299155 1907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 NEUROG2-201ENST00000313341 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.33■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
SIPA1Q96FS4 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIPA1Q96FS4 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
SIPA1Q96FS4 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIPA1Q96FS4 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC25.31■■□□□ 1.64
SIPA1Q96FS4 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
SIPA1Q96FS4 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1Q96FS4 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1Q96FS4 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1Q96FS4 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
SIPA1Q96FS4 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
SIPA1Q96FS4 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIPA1Q96FS4 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIPA1Q96FS4 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIPA1Q96FS4 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIPA1Q96FS4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
SIPA1Q96FS4 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SIPA1Q96FS4 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIPA1Q96FS4 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIPA1Q96FS4 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIPA1Q96FS4 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIPA1Q96FS4 ST7-208ENST00000393451 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIPA1Q96FS4 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
SIPA1Q96FS4 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
SIPA1Q96FS4 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 ABCB10P3-201ENST00000561950 2166 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC25.25■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 ZFAND2B-208ENST00000409594 2021 ntTSL 2 BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 TXNRD2-204ENST00000400521 2115 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.22■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.21■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 SIGMAR1-203ENST00000378892 1743 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
SIPA1Q96FS4 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 ANKS1B-203ENST00000341752 2115 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
SIPA1Q96FS4 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.4 ms