Protein–RNA interactions for Protein: Q96DY5

Rnf112, RING finger protein 112, mousemouse

Predictions only

Length 654 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf112Q96DY5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Rnf112Q96DY5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf112Q96DY5 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf112Q96DY5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf112Q96DY5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf112Q96DY5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf112Q96DY5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Rnf112Q96DY5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf112Q96DY5 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf112Q96DY5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf112Q96DY5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Rnf112Q96DY5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Rnf112Q96DY5 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf112Q96DY5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf112Q96DY5 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Rnf112Q96DY5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf112Q96DY5 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Rnf112Q96DY5 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.7■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Rnf112Q96DY5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf112Q96DY5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf112Q96DY5 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Rnf112Q96DY5 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf112Q96DY5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf112Q96DY5 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Rnf112Q96DY5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf112Q96DY5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf112Q96DY5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Rnf112Q96DY5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf112Q96DY5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf112Q96DY5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf112Q96DY5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Rnf112Q96DY5 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf112Q96DY5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf112Q96DY5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf112Q96DY5 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Rnf112Q96DY5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf112Q96DY5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Rnf112Q96DY5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Rnf112Q96DY5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Rnf112Q96DY5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf112Q96DY5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf112Q96DY5 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Rnf112Q96DY5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms