Protein–RNA interactions for Protein: Q96C74

ROPN1L, Ropporin-1-like protein, humanhuman

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ROPN1LQ96C74 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 SKOR2-203ENST00000620245 3048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
ROPN1LQ96C74 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.01■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 MBOAT7-201ENST00000245615 2529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 SH3GL1-201ENST00000269886 2516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 RASL10A-202ENST00000401450 1720 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 C14orf80-202ENST00000334656 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 KLF3-AS1-202ENST00000440181 2368 ntTSL 2 BASIC23.99■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.96■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
ROPN1LQ96C74 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 NELFB-201ENST00000343053 2698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC23.94■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 MAZ-202ENST00000322945 2532 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 POLR1D-201ENST00000302979 1166 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 MIR3665-201ENST00000578708 105 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 HSD11B1L-202ENST00000339423 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 AC135983.2-203ENST00000454486 1613 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
ROPN1LQ96C74 DTNBP1-202ENST00000344537 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
ROPN1LQ96C74 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ROPN1LQ96C74 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ROPN1LQ96C74 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ROPN1LQ96C74 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
ROPN1LQ96C74 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
ROPN1LQ96C74 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ROPN1LQ96C74 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
ROPN1LQ96C74 C16orf59-202ENST00000483320 1709 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ROPN1LQ96C74 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
ROPN1LQ96C74 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
ROPN1LQ96C74 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
ROPN1LQ96C74 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51.1 ms