Protein–RNA interactions for Protein: Q96C57

C12orf43, Uncharacterized protein C12orf43, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 262 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
C12orf43Q96C57 XKR6-201ENST00000297303 1550 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C12orf43Q96C57 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
C12orf43Q96C57 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 HOXB3-211ENST00000490677 1109 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 FHL2-202ENST00000344213 1769 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 AL133380.1-201ENST00000506013 324 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 GLRB-203ENST00000509282 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 CHMP4B-201ENST00000217402 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 TXN-202ENST00000374517 869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 RALY-201ENST00000246194 1789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 HNRNPAB-205ENST00000506259 1674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
C12orf43Q96C57 ID4-201ENST00000378700 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 HDAC3-201ENST00000305264 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 NPTXR-202ENST00000640136 1503 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 PCYT2-206ENST00000571105 1628 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 LGALS3-201ENST00000254301 1146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 SIGMAR1-205ENST00000477726 840 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 TNFRSF25-204ENST00000356876 1625 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 DNPEP-201ENST00000273075 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
C12orf43Q96C57 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 NOP53-201ENST00000246802 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 C1orf122-204ENST00000468084 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 TMEM8B-203ENST00000377996 2473 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 AP004833.2-201ENST00000532228 1454 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 PCBD2-201ENST00000254908 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 AC097358.2-201ENST00000607541 1159 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 AC136428.2-201ENST00000563187 214 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
C12orf43Q96C57 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms