Protein–RNA interactions for Protein: Q96B54

ZNF428, Zinc finger protein 428, humanhuman

Predictions only

Length 188 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF428Q96B54 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC32.64■■■□□ 2.82
ZNF428Q96B54 EIF5A-208ENST00000573542 1089 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.63■■■□□ 2.81
ZNF428Q96B54 FAM117A-201ENST00000240364 2365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZNF428Q96B54 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZNF428Q96B54 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.62■■■□□ 2.81
ZNF428Q96B54 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF428Q96B54 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC32.61■■■□□ 2.81
ZNF428Q96B54 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZNF428Q96B54 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.6■■■□□ 2.81
ZNF428Q96B54 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZNF428Q96B54 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.59■■■□□ 2.81
ZNF428Q96B54 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZNF428Q96B54 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZNF428Q96B54 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZNF428Q96B54 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZNF428Q96B54 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC32.58■■■□□ 2.81
ZNF428Q96B54 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC32.58■■■□□ 2.81
ZNF428Q96B54 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZNF428Q96B54 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC32.57■■■□□ 2.8
ZNF428Q96B54 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZNF428Q96B54 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZNF428Q96B54 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC32.56■■■□□ 2.8
ZNF428Q96B54 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZNF428Q96B54 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.55■■■□□ 2.8
ZNF428Q96B54 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZNF428Q96B54 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZNF428Q96B54 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZNF428Q96B54 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZNF428Q96B54 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZNF428Q96B54 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZNF428Q96B54 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.53■■■□□ 2.8
ZNF428Q96B54 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ZNF428Q96B54 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC32.52■■■□□ 2.8
ZNF428Q96B54 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ZNF428Q96B54 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ZNF428Q96B54 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC32.52■■■□□ 2.8
ZNF428Q96B54 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.8
ZNF428Q96B54 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.51■■■□□ 2.79
ZNF428Q96B54 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC32.5■■■□□ 2.79
ZNF428Q96B54 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
ZNF428Q96B54 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.49■■■□□ 2.79
ZNF428Q96B54 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC32.49■■■□□ 2.79
ZNF428Q96B54 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF428Q96B54 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF428Q96B54 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF428Q96B54 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF428Q96B54 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF428Q96B54 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF428Q96B54 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF428Q96B54 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF428Q96B54 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF428Q96B54 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF428Q96B54 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF428Q96B54 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF428Q96B54 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF428Q96B54 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC32.48■■■□□ 2.79
ZNF428Q96B54 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.47■■■□□ 2.79
ZNF428Q96B54 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC32.46■■■□□ 2.79
ZNF428Q96B54 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZNF428Q96B54 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZNF428Q96B54 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC32.45■■■□□ 2.79
ZNF428Q96B54 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC32.44■■■□□ 2.78
ZNF428Q96B54 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.44■■■□□ 2.78
ZNF428Q96B54 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZNF428Q96B54 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC32.43■■■□□ 2.78
ZNF428Q96B54 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF428Q96B54 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF428Q96B54 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF428Q96B54 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF428Q96B54 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.42■■■□□ 2.78
ZNF428Q96B54 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNF428Q96B54 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNF428Q96B54 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC32.41■■■□□ 2.78
ZNF428Q96B54 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF428Q96B54 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF428Q96B54 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF428Q96B54 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.4■■■□□ 2.78
ZNF428Q96B54 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZNF428Q96B54 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC32.39■■■□□ 2.78
ZNF428Q96B54 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF428Q96B54 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF428Q96B54 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC32.38■■■□□ 2.77
ZNF428Q96B54 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC32.37■■■□□ 2.77
ZNF428Q96B54 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF428Q96B54 PIGX-201ENST00000296333 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF428Q96B54 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF428Q96B54 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF428Q96B54 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC32.36■■■□□ 2.77
ZNF428Q96B54 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNF428Q96B54 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNF428Q96B54 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNF428Q96B54 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNF428Q96B54 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC32.35■■■□□ 2.77
ZNF428Q96B54 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF428Q96B54 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.34■■■□□ 2.77
ZNF428Q96B54 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZNF428Q96B54 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZNF428Q96B54 FAM168B-201ENST00000389915 944 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC32.33■■■□□ 2.77
ZNF428Q96B54 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC32.32■■■□□ 2.76
ZNF428Q96B54 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC32.32■■■□□ 2.76
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms