Protein–RNA interactions for Protein: Q969X6

UTP4, U3 small nucleolar RNA-associated protein 4 homolog, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 686 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UTP4Q969X6 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 SNHG7-204ENST00000447221 2157 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 PTH1R-201ENST00000313049 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 SAP30-201ENST00000296504 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
UTP4Q969X6 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UTP4Q969X6 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
UTP4Q969X6 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTP4Q969X6 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTP4Q969X6 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
UTP4Q969X6 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UTP4Q969X6 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UTP4Q969X6 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
UTP4Q969X6 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTP4Q969X6 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTP4Q969X6 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
UTP4Q969X6 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTP4Q969X6 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTP4Q969X6 FAM78B-202ENST00000354422 1475 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTP4Q969X6 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTP4Q969X6 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
UTP4Q969X6 ECI1-201ENST00000301729 1541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UTP4Q969X6 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UTP4Q969X6 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
UTP4Q969X6 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
UTP4Q969X6 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
UTP4Q969X6 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 SRXN1-201ENST00000381962 2698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 KAZALD1-201ENST00000370200 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 ALYREF-202ENST00000505490 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 SSBP4-206ENST00000599699 793 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
UTP4Q969X6 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
UTP4Q969X6 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UTP4Q969X6 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
UTP4Q969X6 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTP4Q969X6 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTP4Q969X6 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTP4Q969X6 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTP4Q969X6 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTP4Q969X6 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
UTP4Q969X6 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTP4Q969X6 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTP4Q969X6 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
UTP4Q969X6 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTP4Q969X6 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
UTP4Q969X6 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTP4Q969X6 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTP4Q969X6 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
UTP4Q969X6 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTP4Q969X6 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTP4Q969X6 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTP4Q969X6 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTP4Q969X6 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
UTP4Q969X6 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms