Protein–RNA interactions for Protein: Q969Q1

TRIM63, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM63, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM63Q969Q1 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
TRIM63Q969Q1 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 BIN1-207ENST00000357970 2497 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 TNFRSF25-205ENST00000377782 1632 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 GSTZ1-201ENST00000216465 1338 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 DPF1-206ENST00000420980 2227 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 AC005524.1-203ENST00000586528 451 ntTSL 3 BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
TRIM63Q969Q1 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 WASH5P-204ENST00000632292 975 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 SOS2-201ENST00000216373 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
TRIM63Q969Q1 ECI1-207ENST00000570258 1512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 AC006077.2-201ENST00000623591 457 ntBASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 DACT1-201ENST00000335867 2571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC21.75■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 HMGB1-205ENST00000399494 1282 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 DYNLL1-207ENST00000549989 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 DYNLL1-208ENST00000550178 581 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 SRSF11-203ENST00000370951 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 HRK-201ENST00000257572 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 CEBPB-AS1-201ENST00000613921 2648 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
TRIM63Q969Q1 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms