Protein–RNA interactions for Protein: Q93096

PTP4A1, Protein tyrosine phosphatase type IVA 1, humanhuman

Predictions only

Length 173 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTP4A1Q93096 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
PTP4A1Q93096 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.58■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 LZTS2-201ENST00000370220 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC22.56■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 MAPK8IP1P1-201ENST00000574657 1439 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 AL449106.1-201ENST00000608517 1980 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
PTP4A1Q93096 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
PTP4A1Q93096 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTP4A1Q93096 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTP4A1Q93096 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
PTP4A1Q93096 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTP4A1Q93096 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTP4A1Q93096 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTP4A1Q93096 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTP4A1Q93096 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
PTP4A1Q93096 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
PTP4A1Q93096 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A1Q93096 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A1Q93096 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A1Q93096 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A1Q93096 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
PTP4A1Q93096 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTP4A1Q93096 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTP4A1Q93096 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTP4A1Q93096 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTP4A1Q93096 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
PTP4A1Q93096 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A1Q93096 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
PTP4A1Q93096 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
PTP4A1Q93096 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 VAX2-201ENST00000234392 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 PTPA-202ENST00000347048 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 ACSS1-203ENST00000432802 2438 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 PAPD7-201ENST00000230859 5459 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.18
PTP4A1Q93096 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 CLPTM1L-201ENST00000320895 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 CIB2-204ENST00000557846 934 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 UBE2A-207ENST00000628549 934 ntTSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
PTP4A1Q93096 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 104.4 ms