Protein–RNA interactions for Protein: Q92908

GATA6, Transcription factor GATA-6, humanhuman

Predictions only

Length 595 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GATA6Q92908 SLC9A3R2-202ENST00000432365 1564 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 FAM107B-205ENST00000378467 2374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC25.14■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
GATA6Q92908 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
GATA6Q92908 MMP28-203ENST00000612672 1092 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
GATA6Q92908 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
GATA6Q92908 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GATA6Q92908 GALK1-205ENST00000588479 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
GATA6Q92908 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC25.12■■□□□ 1.61
GATA6Q92908 HDGF-210ENST00000537739 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
GATA6Q92908 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GATA6Q92908 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC25.11■■□□□ 1.61
GATA6Q92908 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GATA6Q92908 GNPTAB-206ENST00000549940 1678 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GATA6Q92908 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GATA6Q92908 COL13A1-214ENST00000522165 2061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
GATA6Q92908 MZT2B-201ENST00000281871 933 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GATA6Q92908 MZT2A-201ENST00000309451 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GATA6Q92908 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
GATA6Q92908 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GATA6Q92908 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.09■■□□□ 1.61
GATA6Q92908 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
GATA6Q92908 PI4KAP1-202ENST00000611748 1906 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GATA6Q92908 TM6SF1-202ENST00000322019 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
GATA6Q92908 RNF130-201ENST00000261947 1766 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 LACTB-201ENST00000261893 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.07■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25.06■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 NOXA1-201ENST00000341349 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 PHF23-205ENST00000571362 1768 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 AGPAT2-202ENST00000371696 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 TNFRSF4-201ENST00000379236 1068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.04■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 MBOAT7-203ENST00000391754 1797 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 ABHD17A-201ENST00000250974 1630 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 PRRX2-201ENST00000372469 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 ZNF768-201ENST00000380412 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC25.02■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 MXD3-203ENST00000439742 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
GATA6Q92908 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.01■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 SSBP4-202ENST00000348495 1721 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 RASSF5-204ENST00000580449 1932 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 TRNP1-201ENST00000522111 1958 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 DSG2-202ENST00000585206 1081 ntTSL 2 BASIC24.99■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 DDX42-201ENST00000359353 2783 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 FADD-201ENST00000301838 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 RAB4B-203ENST00000594800 1173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
GATA6Q92908 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GATA6Q92908 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GATA6Q92908 FTCD-202ENST00000397743 1834 ntTSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
GATA6Q92908 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
GATA6Q92908 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.94■■□□□ 1.58
GATA6Q92908 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GATA6Q92908 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
GATA6Q92908 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GATA6Q92908 TMEM80-202ENST00000397512 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
GATA6Q92908 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GATA6Q92908 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GATA6Q92908 CPNE1-203ENST00000397442 1695 ntTSL 5 BASIC24.93■■□□□ 1.58
GATA6Q92908 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms