Protein–RNA interactions for Protein: Q92797

SYMPK, Symplekin, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYMPKQ92797 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SYMPKQ92797 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SYMPKQ92797 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SYMPKQ92797 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYMPKQ92797 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYMPKQ92797 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYMPKQ92797 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.73■■■□□ 2.19
SYMPKQ92797 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SYMPKQ92797 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYMPKQ92797 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYMPKQ92797 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYMPKQ92797 SNX15-202ENST00000377244 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SYMPKQ92797 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SYMPKQ92797 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.7■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.67■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC28.65■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SYMPKQ92797 NRBF2-202ENST00000435510 1816 ntTSL 2 BASIC28.64■■■□□ 2.17
SYMPKQ92797 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYMPKQ92797 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYMPKQ92797 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYMPKQ92797 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SYMPKQ92797 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYMPKQ92797 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYMPKQ92797 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYMPKQ92797 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SYMPKQ92797 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.61■■■□□ 2.17
SYMPKQ92797 CCND3-203ENST00000372991 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYMPKQ92797 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYMPKQ92797 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC28.6■■■□□ 2.17
SYMPKQ92797 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SYMPKQ92797 AL121749.1-202ENST00000609313 2153 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SYMPKQ92797 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYMPKQ92797 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SYMPKQ92797 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.58■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC28.55■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC28.54■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 NPB-202ENST00000573081 2154 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.54■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 HDGF-201ENST00000357325 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 ROM1-201ENST00000278833 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.16
SYMPKQ92797 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC28.51■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC28.5■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.49■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC28.48■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
SYMPKQ92797 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.2 ms