Protein–RNA interactions for Protein: Q92769

HDAC2, Histone deacetylase 2, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 488 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDAC2Q92769 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC2Q92769 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC2Q92769 GFRA4-202ENST00000319242 900 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
HDAC2Q92769 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC2Q92769 GRK6-206ENST00000507633 1660 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC2Q92769 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
HDAC2Q92769 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC2Q92769 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC2Q92769 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC2Q92769 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC2Q92769 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
HDAC2Q92769 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC2Q92769 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC2Q92769 ENKD1-201ENST00000243878 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDAC2Q92769 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC2Q92769 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDAC2Q92769 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 AC093323.1-202ENST00000635031 2045 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 RPS2-209ENST00000529806 993 ntTSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDAC2Q92769 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 TXNL4A-210ENST00000591711 669 ntTSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 MISP3-202ENST00000587086 1535 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 CACNG6-202ENST00000346968 645 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC23.09■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
HDAC2Q92769 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 MSANTD2-203ENST00000524950 1109 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 COQ2-202ENST00000311469 1641 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
HDAC2Q92769 FAM185A-202ENST00000413034 1179 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms