Protein–RNA interactions for Protein: Q92620

DHX38, Pre-mRNA-splicing factor ATP-dependent RNA helicase PRP16, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,227 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DHX38Q92620 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 HYI-213ENST00000583037 1322 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 AC092296.2-201ENST00000589470 999 ntBASIC28.17■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 FOXQ1-201ENST00000296839 2309 ntAPPRIS P1 BASIC28.17■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 FOXE3-201ENST00000335071 1981 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC28.16■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 EFNA3-201ENST00000368408 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC28.15■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC28.15■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 ACOT7-201ENST00000361521 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
DHX38Q92620 CERS2-205ENST00000368954 2505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 SNX24-201ENST00000261369 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 BTBD19-201ENST00000409335 1214 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 RUNDC3A-206ENST00000590941 1675 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 ST6GALNAC6-203ENST00000373142 2448 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.11■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 FGF18-201ENST00000274625 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 MAPK13-201ENST00000211287 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 MCCD1-201ENST00000376191 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 AGFG1-205ENST00000409979 2089 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 RTN4R-201ENST00000043402 2157 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 ACTG1-210ENST00000575842 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 GPR137-202ENST00000377702 1478 ntTSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 IRX1-201ENST00000302006 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 TESK1-206ENST00000620767 2438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.08■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
DHX38Q92620 BCL7C-201ENST00000215115 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 PRELID2-207ENST00000511435 1894 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 WDSUB1-205ENST00000409990 1920 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 PGM5P2-201ENST00000613141 1980 ntTSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC28.06■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 GGA1-204ENST00000381756 2107 ntTSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 SP8-201ENST00000361443 1714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC28.04■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC28.04■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 HOXB3-212ENST00000498678 2196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC28.01■■■□□ 2.08
DHX38Q92620 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX38Q92620 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX38Q92620 ATF4-201ENST00000337304 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.01■■■□□ 2.07
DHX38Q92620 QDPR-208ENST00000513615 1188 ntTSL 2 BASIC28■■■□□ 2.07
DHX38Q92620 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28■■■□□ 2.07
DHX38Q92620 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX38Q92620 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX38Q92620 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX38Q92620 CAPNS1-216ENST00000628306 1389 ntTSL 5 BASIC27.99■■■□□ 2.07
DHX38Q92620 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DHX38Q92620 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.98■■■□□ 2.07
DHX38Q92620 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DHX38Q92620 EXOC3L4-201ENST00000380069 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
DHX38Q92620 SHF-206ENST00000560471 2499 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
DHX38Q92620 AL139393.2-201ENST00000608721 2025 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
DHX38Q92620 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC27.96■■■□□ 2.07
DHX38Q92620 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DHX38Q92620 LINC01770-201ENST00000417917 634 ntTSL 2 BASIC27.96■■■□□ 2.07
DHX38Q92620 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
DHX38Q92620 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 61.1 ms