Protein–RNA interactions for Protein: Q92618

ZNF516, Zinc finger protein 516, humanhuman

Predictions only

Length 1,163 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF516Q92618 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF516Q92618 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF516Q92618 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF516Q92618 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
ZNF516Q92618 AC092902.2-221ENST00000628476 965 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF516Q92618 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
ZNF516Q92618 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
ZNF516Q92618 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF516Q92618 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF516Q92618 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
ZNF516Q92618 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF516Q92618 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF516Q92618 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF516Q92618 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF516Q92618 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
ZNF516Q92618 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF516Q92618 POLR3H-201ENST00000337566 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
ZNF516Q92618 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.26■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 PLSCR3-202ENST00000535512 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 ACOT12-204ENST00000513751 612 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.24■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 HDHD5-202ENST00000336737 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 PLEKHF1-201ENST00000436066 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
ZNF516Q92618 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC27.19■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.18■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 PARD6A-201ENST00000219255 1248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC27.17■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 HAND2-201ENST00000359562 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.14■■□□□ 1.94
ZNF516Q92618 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZNF516Q92618 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZNF516Q92618 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
ZNF516Q92618 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF516Q92618 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF516Q92618 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
ZNF516Q92618 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF516Q92618 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF516Q92618 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF516Q92618 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
ZNF516Q92618 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF516Q92618 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
ZNF516Q92618 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF516Q92618 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.1■■□□□ 1.93
ZNF516Q92618 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF516Q92618 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF516Q92618 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF516Q92618 TNK2-201ENST00000333602 5270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.09■■□□□ 1.93
ZNF516Q92618 RUNX2-211ENST00000625924 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF516Q92618 EPB41L4A-AS2-201ENST00000623705 1396 ntBASIC27.08■■□□□ 1.93
ZNF516Q92618 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF516Q92618 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF516Q92618 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC27.07■■□□□ 1.92
ZNF516Q92618 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF516Q92618 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF516Q92618 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF516Q92618 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.06■■□□□ 1.92
ZNF516Q92618 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF516Q92618 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
ZNF516Q92618 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms