Protein–RNA interactions for Protein: Q92574

TSC1, Hamartin, humanhuman

Predictions only

Length 1,164 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSC1Q92574 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSC1Q92574 PLEKHG6-206ENST00000536531 1683 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSC1Q92574 GSTP1-202ENST00000398606 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSC1Q92574 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSC1Q92574 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
TSC1Q92574 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSC1Q92574 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSC1Q92574 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSC1Q92574 AL162393.1-201ENST00000437852 946 ntBASIC27.4■■□□□ 1.98
TSC1Q92574 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.4■■□□□ 1.98
TSC1Q92574 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSC1Q92574 AC004080.1-201ENST00000523608 757 ntTSL 2 BASIC27.39■■□□□ 1.98
TSC1Q92574 BTBD19-203ENST00000450269 1572 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.39■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 NRG1-221ENST00000614767 762 ntTSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 GAL3ST1-204ENST00000402369 1712 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 CIC-201ENST00000160740 6111 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.38■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 DUSP14-206ENST00000617516 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC27.37■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.37■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 PELI3-203ENST00000524466 1671 ntTSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 MARCH11-201ENST00000332432 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.36■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 PPP3CC-204ENST00000518852 1598 ntTSL 2 BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 RAX-201ENST00000256852 2935 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 HSD11B1L-209ENST00000577917 1553 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 PIK3R2-208ENST00000617642 1446 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 CARS2-201ENST00000257347 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.34■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 AL139393.1-201ENST00000417479 573 ntTSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.97
TSC1Q92574 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.33■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 MTNR1A-201ENST00000307161 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC27.31■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 AC010864.1-201ENST00000609407 1511 ntBASIC27.31■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC27.3■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 VEGFA-231ENST00000640499 1188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 RUNX2-203ENST00000371436 1588 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 SCRT2-201ENST00000246104 3577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 MIR762-201ENST00000390236 83 ntBASIC27.27■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 SOX10-201ENST00000360880 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 F8A3-201ENST00000622749 1759 ntAPPRIS P1 BASIC27.27■■□□□ 1.96
TSC1Q92574 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 SPIRE1-202ENST00000409402 5665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 SEC61G-204ENST00000450622 512 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 MISP3-201ENST00000269720 1424 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 AC012629.2-201ENST00000606513 377 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 LANCL3-203ENST00000614025 1469 ntTSL 2 BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 FSD1L-208ENST00000495708 1906 ntTSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 PPP1CC-208ENST00000551676 1581 ntTSL 2 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 STUB1-205ENST00000565677 1560 ntTSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC27.22■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 CIB1-201ENST00000328649 1247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 CIB1-202ENST00000612800 1096 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC27.21■■□□□ 1.95
TSC1Q92574 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.94
TSC1Q92574 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC27.2■■□□□ 1.94
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.3 ms