Protein–RNA interactions for Protein: Q92547

TOPBP1, DNA topoisomerase 2-binding protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TOPBP1Q92547 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC43.45■■■■■ 4.55
TOPBP1Q92547 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC43.44■■■■■ 4.55
TOPBP1Q92547 C9orf147-202ENST00000457681 561 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
TOPBP1Q92547 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC43.44■■■■■ 4.54
TOPBP1Q92547 FAHD1-204ENST00000615972 757 ntTSL 5 BASIC43.44■■■■■ 4.54
TOPBP1Q92547 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC43.43■■■■■ 4.54
TOPBP1Q92547 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC43.42■■■■■ 4.54
TOPBP1Q92547 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.41■■■■■ 4.54
TOPBP1Q92547 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
TOPBP1Q92547 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC43.4■■■■■ 4.54
TOPBP1Q92547 ELK4-201ENST00000289703 2118 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
TOPBP1Q92547 PAOX-206ENST00000480071 1324 ntTSL 1 (best) BASIC43.4■■■■■ 4.54
TOPBP1Q92547 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
TOPBP1Q92547 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC43.39■■■■■ 4.54
TOPBP1Q92547 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC43.37■■■■■ 4.53
TOPBP1Q92547 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.37■■■■■ 4.53
TOPBP1Q92547 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
TOPBP1Q92547 RASGRP2-204ENST00000377487 642 ntTSL 2 BASIC43.36■■■■■ 4.53
TOPBP1Q92547 KHDRBS3-201ENST00000355849 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.36■■■■■ 4.53
TOPBP1Q92547 CCDC160-202ENST00000517294 1790 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.35■■■■■ 4.53
TOPBP1Q92547 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC43.35■■■■■ 4.53
TOPBP1Q92547 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC43.35■■■■■ 4.53
TOPBP1Q92547 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC43.35■■■■■ 4.53
TOPBP1Q92547 PTRH1-208ENST00000543175 814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.34■■■■■ 4.53
TOPBP1Q92547 HAUS7-201ENST00000370210 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC43.34■■■■■ 4.53
TOPBP1Q92547 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC43.33■■■■■ 4.53
TOPBP1Q92547 RAB26-201ENST00000210187 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
TOPBP1Q92547 MKNK2-202ENST00000309340 1744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.33■■■■■ 4.53
TOPBP1Q92547 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
TOPBP1Q92547 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.53
TOPBP1Q92547 TIE1-210ENST00000538015 1140 ntTSL 1 (best) BASIC43.32■■■■■ 4.52
TOPBP1Q92547 AC093390.2-201ENST00000638628 1007 ntTSL 5 BASIC43.32■■■■■ 4.52
TOPBP1Q92547 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.31■■■■■ 4.52
TOPBP1Q92547 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.3■■■■■ 4.52
TOPBP1Q92547 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC43.3■■■■■ 4.52
TOPBP1Q92547 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC43.3■■■■■ 4.52
TOPBP1Q92547 AC009511.2-201ENST00000545904 679 ntTSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
TOPBP1Q92547 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC43.29■■■■■ 4.52
TOPBP1Q92547 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
TOPBP1Q92547 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC43.29■■■■■ 4.52
TOPBP1Q92547 ATRNL1-209ENST00000609571 1818 ntTSL 1 (best) BASIC43.29■■■■■ 4.52
TOPBP1Q92547 AC009299.2-201ENST00000482477 511 ntBASIC43.28■■■■■ 4.52
TOPBP1Q92547 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC43.28■■■■■ 4.52
TOPBP1Q92547 PGM5-201ENST00000396392 1782 ntTSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
TOPBP1Q92547 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.27■■■■■ 4.52
TOPBP1Q92547 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC43.27■■■■■ 4.52
TOPBP1Q92547 MORF4L1-203ENST00000426013 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.26■■■■■ 4.52
TOPBP1Q92547 MTURN-203ENST00000409688 843 ntTSL 2 BASIC43.26■■■■■ 4.52
TOPBP1Q92547 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC43.26■■■■■ 4.52
TOPBP1Q92547 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.25■■■■■ 4.51
TOPBP1Q92547 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.24■■■■■ 4.51
TOPBP1Q92547 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.23■■■■■ 4.51
TOPBP1Q92547 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC43.22■■■■■ 4.51
TOPBP1Q92547 AC053527.1-201ENST00000502790 685 ntTSL 3 BASIC43.22■■■■■ 4.51
TOPBP1Q92547 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
TOPBP1Q92547 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
TOPBP1Q92547 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC43.22■■■■■ 4.51
TOPBP1Q92547 CSPG5-205ENST00000610462 2073 ntTSL 5 BASIC43.22■■■■■ 4.51
TOPBP1Q92547 SLC16A8-201ENST00000320521 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
TOPBP1Q92547 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
TOPBP1Q92547 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.22■■■■■ 4.51
TOPBP1Q92547 PANK2-207ENST00000610179 1807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC43.21■■■■■ 4.51
TOPBP1Q92547 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC43.21■■■■■ 4.51
TOPBP1Q92547 EFNA1-202ENST00000368407 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.2■■■■■ 4.51
TOPBP1Q92547 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
TOPBP1Q92547 SLC16A11-201ENST00000308009 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC43.18■■■■■ 4.5
TOPBP1Q92547 SOHLH1-202ENST00000425225 1411 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.18■■■■■ 4.5
TOPBP1Q92547 SDF2L1-201ENST00000248958 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
TOPBP1Q92547 PNMT-201ENST00000269582 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.17■■■■■ 4.5
TOPBP1Q92547 C11orf63-202ENST00000307257 1964 ntTSL 2 BASIC43.17■■■■■ 4.5
TOPBP1Q92547 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC43.17■■■■■ 4.5
TOPBP1Q92547 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC43.15■■■■■ 4.5
TOPBP1Q92547 MPC1-201ENST00000341756 976 ntTSL 1 (best) BASIC43.14■■■■■ 4.5
TOPBP1Q92547 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC43.14■■■■■ 4.5
TOPBP1Q92547 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC43.14■■■■■ 4.5
TOPBP1Q92547 MPC1-206ENST00000621630 977 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
TOPBP1Q92547 MPC1-207ENST00000621685 1192 ntTSL 5 BASIC43.14■■■■■ 4.5
TOPBP1Q92547 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC43.13■■■■■ 4.5
TOPBP1Q92547 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
TOPBP1Q92547 TMEM151B-201ENST00000438774 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
TOPBP1Q92547 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC43.12■■■■■ 4.49
TOPBP1Q92547 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC43.12■■■■■ 4.49
TOPBP1Q92547 RUNX2-205ENST00000465038 1770 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC43.11■■■■■ 4.49
TOPBP1Q92547 FOXD1-202ENST00000615637 2272 ntAPPRIS P1 BASIC43.11■■■■■ 4.49
TOPBP1Q92547 FTCD-203ENST00000397746 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.11■■■■■ 4.49
TOPBP1Q92547 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC43.1■■■■■ 4.49
TOPBP1Q92547 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC43.1■■■■■ 4.49
TOPBP1Q92547 CHPT1-205ENST00000549872 2001 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC43.1■■■■■ 4.49
TOPBP1Q92547 KRT8P33-201ENST00000508125 1423 ntBASIC43.1■■■■■ 4.49
TOPBP1Q92547 NAXE-203ENST00000368235 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
TOPBP1Q92547 S100A6-201ENST00000368719 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.09■■■■■ 4.49
TOPBP1Q92547 GUSBP5-201ENST00000418136 578 ntBASIC43.08■■■■■ 4.49
TOPBP1Q92547 PDXP-201ENST00000215904 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.08■■■■■ 4.49
TOPBP1Q92547 AC055876.1-201ENST00000430589 895 ntTSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.49
TOPBP1Q92547 CD63-201ENST00000257857 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 YIF1A-201ENST00000359461 943 ntTSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 YIF1A-203ENST00000376901 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC43.07■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 TMEM238-201ENST00000444469 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC43.07■■■■■ 4.48
TOPBP1Q92547 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC43.06■■■■■ 4.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.3 ms