Protein–RNA interactions for Protein: Q922F4

Tubb6, Tubulin beta-6 chain, mousemouse

Predictions only

Length 447 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tubb6Q922F4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tubb6Q922F4 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tubb6Q922F4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tubb6Q922F4 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.94■■□□□ 1.9
Tubb6Q922F4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC26.93■■□□□ 1.9
Tubb6Q922F4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tubb6Q922F4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tubb6Q922F4 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.92■■□□□ 1.9
Tubb6Q922F4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC26.92■■□□□ 1.9
Tubb6Q922F4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tubb6Q922F4 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tubb6Q922F4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tubb6Q922F4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tubb6Q922F4 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.91■■□□□ 1.9
Tubb6Q922F4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Tubb6Q922F4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC26.9■■□□□ 1.9
Tubb6Q922F4 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tubb6Q922F4 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.9■■□□□ 1.9
Tubb6Q922F4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tubb6Q922F4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tubb6Q922F4 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.9
Tubb6Q922F4 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.89■■□□□ 1.89
Tubb6Q922F4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tubb6Q922F4 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tubb6Q922F4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tubb6Q922F4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tubb6Q922F4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.88■■□□□ 1.89
Tubb6Q922F4 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tubb6Q922F4 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tubb6Q922F4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tubb6Q922F4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tubb6Q922F4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tubb6Q922F4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.87■■□□□ 1.89
Tubb6Q922F4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC26.86■■□□□ 1.89
Tubb6Q922F4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tubb6Q922F4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tubb6Q922F4 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.85■■□□□ 1.89
Tubb6Q922F4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tubb6Q922F4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC26.84■■□□□ 1.89
Tubb6Q922F4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.84■■□□□ 1.89
Tubb6Q922F4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tubb6Q922F4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.83■■□□□ 1.89
Tubb6Q922F4 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.82■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC26.82■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.81■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.8■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC26.79■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC26.78■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.77■■□□□ 1.88
Tubb6Q922F4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.76■■□□□ 1.87
Tubb6Q922F4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tubb6Q922F4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tubb6Q922F4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tubb6Q922F4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.75■■□□□ 1.87
Tubb6Q922F4 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tubb6Q922F4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tubb6Q922F4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC26.74■■□□□ 1.87
Tubb6Q922F4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC26.73■■□□□ 1.87
Tubb6Q922F4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tubb6Q922F4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tubb6Q922F4 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC26.72■■□□□ 1.87
Tubb6Q922F4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.71■■□□□ 1.87
Tubb6Q922F4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.71■■□□□ 1.87
Tubb6Q922F4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tubb6Q922F4 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tubb6Q922F4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tubb6Q922F4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tubb6Q922F4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.7■■□□□ 1.86
Tubb6Q922F4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.69■■□□□ 1.86
Tubb6Q922F4 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tubb6Q922F4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tubb6Q922F4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tubb6Q922F4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.68■■□□□ 1.86
Tubb6Q922F4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tubb6Q922F4 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tubb6Q922F4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tubb6Q922F4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC26.67■■□□□ 1.86
Tubb6Q922F4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tubb6Q922F4 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.66■■□□□ 1.86
Tubb6Q922F4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.65■■□□□ 1.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 81.1 ms