Protein–RNA interactions for Protein: Q921M3

Sf3b3, Splicing factor 3B subunit 3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sf3b3Q921M3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sf3b3Q921M3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Sf3b3Q921M3 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sf3b3Q921M3 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sf3b3Q921M3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sf3b3Q921M3 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Sf3b3Q921M3 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC28.47■■■□□ 2.15
Sf3b3Q921M3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Sf3b3Q921M3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sf3b3Q921M3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Sf3b3Q921M3 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sf3b3Q921M3 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Sf3b3Q921M3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sf3b3Q921M3 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sf3b3Q921M3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Sf3b3Q921M3 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sf3b3Q921M3 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sf3b3Q921M3 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sf3b3Q921M3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sf3b3Q921M3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.42■■■□□ 2.14
Sf3b3Q921M3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Sf3b3Q921M3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sf3b3Q921M3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Sf3b3Q921M3 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sf3b3Q921M3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC28.4■■■□□ 2.14
Sf3b3Q921M3 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sf3b3Q921M3 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sf3b3Q921M3 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Sf3b3Q921M3 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sf3b3Q921M3 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sf3b3Q921M3 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Sf3b3Q921M3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.13
Sf3b3Q921M3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sf3b3Q921M3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Sf3b3Q921M3 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sf3b3Q921M3 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sf3b3Q921M3 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sf3b3Q921M3 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Sf3b3Q921M3 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.35■■■□□ 2.13
Sf3b3Q921M3 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC28.35■■■□□ 2.13
Sf3b3Q921M3 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sf3b3Q921M3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sf3b3Q921M3 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sf3b3Q921M3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sf3b3Q921M3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Sf3b3Q921M3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sf3b3Q921M3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sf3b3Q921M3 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC28.33■■■□□ 2.13
Sf3b3Q921M3 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sf3b3Q921M3 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sf3b3Q921M3 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.32■■■□□ 2.12
Sf3b3Q921M3 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Sf3b3Q921M3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sf3b3Q921M3 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Sf3b3Q921M3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sf3b3Q921M3 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sf3b3Q921M3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Sf3b3Q921M3 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sf3b3Q921M3 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Sf3b3Q921M3 Kctd6-201ENSMUST00000022272 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Sf3b3Q921M3 Pth1r-202ENSMUST00000166716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sf3b3Q921M3 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sf3b3Q921M3 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sf3b3Q921M3 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sf3b3Q921M3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sf3b3Q921M3 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Sf3b3Q921M3 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Sf3b3Q921M3 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Sf3b3Q921M3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sf3b3Q921M3 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sf3b3Q921M3 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Sf3b3Q921M3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Sf3b3Q921M3 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sf3b3Q921M3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sf3b3Q921M3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Sf3b3Q921M3 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sf3b3Q921M3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sf3b3Q921M3 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sf3b3Q921M3 Adap1-201ENSMUST00000110865 2557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Sf3b3Q921M3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Sf3b3Q921M3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sf3b3Q921M3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Sf3b3Q921M3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC28.18■■■□□ 2.1
Sf3b3Q921M3 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sf3b3Q921M3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Sf3b3Q921M3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sf3b3Q921M3 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC28.16■■■□□ 2.1
Sf3b3Q921M3 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sf3b3Q921M3 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sf3b3Q921M3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sf3b3Q921M3 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sf3b3Q921M3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Sf3b3Q921M3 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sf3b3Q921M3 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sf3b3Q921M3 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sf3b3Q921M3 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Sf3b3Q921M3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC28.14■■■□□ 2.09
Sf3b3Q921M3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sf3b3Q921M3 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Sf3b3Q921M3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.2 ms