Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Maz-202ENSMUST00000205461 796 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
Rrp1bQ91YK2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrp1bQ91YK2 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrp1bQ91YK2 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrp1bQ91YK2 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrp1bQ91YK2 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrp1bQ91YK2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Rrp1bQ91YK2 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrp1bQ91YK2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrp1bQ91YK2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Rrp1bQ91YK2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrp1bQ91YK2 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrp1bQ91YK2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrp1bQ91YK2 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Rrp1bQ91YK2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Rrp1bQ91YK2 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrp1bQ91YK2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrp1bQ91YK2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrp1bQ91YK2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrp1bQ91YK2 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Rrp1bQ91YK2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrp1bQ91YK2 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrp1bQ91YK2 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Rrp1bQ91YK2 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrp1bQ91YK2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrp1bQ91YK2 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrp1bQ91YK2 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Rrp1bQ91YK2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrp1bQ91YK2 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrp1bQ91YK2 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Rrp1bQ91YK2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Rrp1bQ91YK2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rrp1bQ91YK2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rrp1bQ91YK2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.36■■□□□ 1.49
Rrp1bQ91YK2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rrp1bQ91YK2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Rrp1bQ91YK2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrp1bQ91YK2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrp1bQ91YK2 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrp1bQ91YK2 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrp1bQ91YK2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Rrp1bQ91YK2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rrp1bQ91YK2 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rrp1bQ91YK2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rrp1bQ91YK2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rrp1bQ91YK2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Rrp1bQ91YK2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Rrp1bQ91YK2 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Rrp1bQ91YK2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rrp1bQ91YK2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Rrp1bQ91YK2 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp1bQ91YK2 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp1bQ91YK2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp1bQ91YK2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Rrp1bQ91YK2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrp1bQ91YK2 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrp1bQ91YK2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Rrp1bQ91YK2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.2 ms