Protein–RNA interactions for Protein: Q91YH5

Atl3, Atlastin-3, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atl3Q91YH5 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atl3Q91YH5 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
Atl3Q91YH5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.55■■■□□ 2.16
Atl3Q91YH5 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Atl3Q91YH5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atl3Q91YH5 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.53■■■□□ 2.16
Atl3Q91YH5 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atl3Q91YH5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atl3Q91YH5 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.52■■■□□ 2.16
Atl3Q91YH5 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atl3Q91YH5 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.51■■■□□ 2.15
Atl3Q91YH5 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atl3Q91YH5 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atl3Q91YH5 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC28.5■■■□□ 2.15
Atl3Q91YH5 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atl3Q91YH5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC28.49■■■□□ 2.15
Atl3Q91YH5 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.49■■■□□ 2.15
Atl3Q91YH5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atl3Q91YH5 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atl3Q91YH5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.48■■■□□ 2.15
Atl3Q91YH5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.47■■■□□ 2.15
Atl3Q91YH5 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atl3Q91YH5 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atl3Q91YH5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atl3Q91YH5 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atl3Q91YH5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.46■■■□□ 2.15
Atl3Q91YH5 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.45■■■□□ 2.14
Atl3Q91YH5 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atl3Q91YH5 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atl3Q91YH5 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atl3Q91YH5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.44■■■□□ 2.14
Atl3Q91YH5 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atl3Q91YH5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atl3Q91YH5 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC28.43■■■□□ 2.14
Atl3Q91YH5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atl3Q91YH5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atl3Q91YH5 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.42■■■□□ 2.14
Atl3Q91YH5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atl3Q91YH5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atl3Q91YH5 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.41■■■□□ 2.14
Atl3Q91YH5 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atl3Q91YH5 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.4■■■□□ 2.14
Atl3Q91YH5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atl3Q91YH5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atl3Q91YH5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.39■■■□□ 2.14
Atl3Q91YH5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC28.38■■■□□ 2.13
Atl3Q91YH5 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.38■■■□□ 2.13
Atl3Q91YH5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC28.37■■■□□ 2.13
Atl3Q91YH5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atl3Q91YH5 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atl3Q91YH5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.37■■■□□ 2.13
Atl3Q91YH5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atl3Q91YH5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atl3Q91YH5 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC28.36■■■□□ 2.13
Atl3Q91YH5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atl3Q91YH5 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.35■■■□□ 2.13
Atl3Q91YH5 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atl3Q91YH5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atl3Q91YH5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atl3Q91YH5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.34■■■□□ 2.13
Atl3Q91YH5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.33■■■□□ 2.13
Atl3Q91YH5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atl3Q91YH5 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.32■■■□□ 2.12
Atl3Q91YH5 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atl3Q91YH5 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atl3Q91YH5 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atl3Q91YH5 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.31■■■□□ 2.12
Atl3Q91YH5 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atl3Q91YH5 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Atl3Q91YH5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atl3Q91YH5 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atl3Q91YH5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atl3Q91YH5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Atl3Q91YH5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atl3Q91YH5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Atl3Q91YH5 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atl3Q91YH5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atl3Q91YH5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Atl3Q91YH5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.12
Atl3Q91YH5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atl3Q91YH5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Atl3Q91YH5 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC28.25■■■□□ 2.11
Atl3Q91YH5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atl3Q91YH5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Atl3Q91YH5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atl3Q91YH5 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atl3Q91YH5 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atl3Q91YH5 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atl3Q91YH5 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.23■■■□□ 2.11
Atl3Q91YH5 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atl3Q91YH5 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atl3Q91YH5 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Atl3Q91YH5 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atl3Q91YH5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atl3Q91YH5 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atl3Q91YH5 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Atl3Q91YH5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Atl3Q91YH5 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Atl3Q91YH5 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Atl3Q91YH5 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.6 ms