Protein–RNA interactions for Protein: Q91WC3

Acsl6, Long-chain-fatty-acid--CoA ligase 6, mousemouse

Predictions only

Length 697 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Acsl6Q91WC3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Acsl6Q91WC3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC22.4■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Acsl6Q91WC3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.33■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Acsl6Q91WC3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Acsl6Q91WC3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.7 ms