Protein–RNA interactions for Protein: Q91WA3

Hdac11, Histone deacetylase 11, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hdac11Q91WA3 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Hdac11Q91WA3 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.64■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Hdac11Q91WA3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Hdac11Q91WA3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac11Q91WA3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac11Q91WA3 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac11Q91WA3 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac11Q91WA3 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Hdac11Q91WA3 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac11Q91WA3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac11Q91WA3 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac11Q91WA3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
Hdac11Q91WA3 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac11Q91WA3 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac11Q91WA3 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac11Q91WA3 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac11Q91WA3 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Hdac11Q91WA3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac11Q91WA3 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac11Q91WA3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac11Q91WA3 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac11Q91WA3 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Hdac11Q91WA3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac11Q91WA3 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac11Q91WA3 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Hdac11Q91WA3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Hdac11Q91WA3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.9 ms