Protein–RNA interactions for Protein: Q8WXF7

ATL1, Atlastin-1, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL1Q8WXF7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 ST6GALNAC6-205ENST00000373146 2460 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 VEGFC-202ENST00000618562 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 PLSCR3-214ENST00000619711 2066 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 DHRS13-202ENST00000394901 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 TMEM55B-201ENST00000250489 1961 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 ANKRD65-205ENST00000537107 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 MFSD12-201ENST00000355415 2124 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 U2AF2-206ENST00000590551 1104 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
ATL1Q8WXF7 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
ATL1Q8WXF7 SCCPDH-201ENST00000366510 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL1Q8WXF7 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL1Q8WXF7 AGPS-202ENST00000409888 815 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL1Q8WXF7 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
ATL1Q8WXF7 HOOK2-201ENST00000264827 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL1Q8WXF7 AURKAIP1-203ENST00000338370 1072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
ATL1Q8WXF7 GABRA5-203ENST00000400081 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL1Q8WXF7 FAM220A-201ENST00000313324 2214 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL1Q8WXF7 TRIM52-AS1-203ENST00000509252 529 ntTSL 3 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL1Q8WXF7 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL1Q8WXF7 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ATL1Q8WXF7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ATL1Q8WXF7 THRA-204ENST00000546243 1909 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL1Q8WXF7 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL1Q8WXF7 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL1Q8WXF7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL1Q8WXF7 RNF166-209ENST00000567844 633 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL1Q8WXF7 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ATL1Q8WXF7 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
ATL1Q8WXF7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 CLEC3B-202ENST00000428034 752 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 C9orf40-201ENST00000376854 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 DPY19L1-209ENST00000638088 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 GADD45G-201ENST00000252506 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 NPDC1-201ENST00000371600 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 P2RX2-203ENST00000350048 1344 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 PICK1-201ENST00000356976 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 ING2-201ENST00000302327 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 PDCD2-209ENST00000542896 1082 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ATL1Q8WXF7 ANKRD53-203ENST00000441349 1797 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 MACF1-219ENST00000484793 834 ntTSL 2 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 HOXB3-201ENST00000311626 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 HSD17B1-201ENST00000225929 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 RP9-201ENST00000297157 1121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 GNPTAB-201ENST00000299314 5701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ATL1Q8WXF7 TCFL5-201ENST00000217162 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms