Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWY3

PRPF31, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp31, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF31Q8WWY3 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 GNAS-207ENST00000354359 1975 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 GNAS-210ENST00000371085 1972 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 ESRRA-201ENST00000000442 2215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 PTPMT1-203ENST00000426530 1014 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 BLOC1S3-202ENST00000587722 732 ntAPPRIS P1 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 DERA-201ENST00000428559 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 SDCCAG3-201ENST00000298537 2314 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 GPX1-201ENST00000419349 1106 ntBASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 PTPRF-216ENST00000617451 1129 ntTSL 5 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 CLK2-201ENST00000355560 2120 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 IL17D-201ENST00000304920 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF31Q8WWY3 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRPF31Q8WWY3 PDPK1-203ENST00000389224 2416 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRPF31Q8WWY3 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC27.89■■■□□ 2.05
PRPF31Q8WWY3 AQP1-203ENST00000409899 1009 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF31Q8WWY3 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF31Q8WWY3 NME2-205ENST00000512737 826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF31Q8WWY3 GNAS-211ENST00000371095 1931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF31Q8WWY3 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF31Q8WWY3 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF31Q8WWY3 PIP4K2B-204ENST00000619039 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF31Q8WWY3 GAL3ST3-203ENST00000527878 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF31Q8WWY3 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF31Q8WWY3 VWA1-201ENST00000338660 2147 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF31Q8WWY3 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF31Q8WWY3 HOXD13-201ENST00000392539 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF31Q8WWY3 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF31Q8WWY3 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC27.85■■■□□ 2.05
PRPF31Q8WWY3 ARHGAP22-202ENST00000374170 2107 ntTSL 5 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF31Q8WWY3 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF31Q8WWY3 TBCC-201ENST00000372876 1616 ntAPPRIS P1 BASIC27.84■■■□□ 2.05
PRPF31Q8WWY3 TMEM268-201ENST00000288502 2314 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF31Q8WWY3 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.83■■■□□ 2.05
PRPF31Q8WWY3 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF31Q8WWY3 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF31Q8WWY3 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF31Q8WWY3 CMPK2-203ENST00000458098 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF31Q8WWY3 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF31Q8WWY3 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF31Q8WWY3 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC27.82■■■□□ 2.04
PRPF31Q8WWY3 GSX1-201ENST00000302945 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF31Q8WWY3 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF31Q8WWY3 TMEM187-201ENST00000369982 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF31Q8WWY3 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF31Q8WWY3 TNFSF12-201ENST00000293825 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.81■■■□□ 2.04
PRPF31Q8WWY3 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF31Q8WWY3 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF31Q8WWY3 IGFBP2-201ENST00000233809 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF31Q8WWY3 SECTM1-201ENST00000269389 2235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF31Q8WWY3 RRAGC-201ENST00000373001 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.8■■■□□ 2.04
PRPF31Q8WWY3 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC27.79■■■□□ 2.04
PRPF31Q8WWY3 SHARPIN-202ENST00000398712 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF31Q8WWY3 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC27.78■■■□□ 2.04
PRPF31Q8WWY3 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF31Q8WWY3 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF31Q8WWY3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC27.77■■■□□ 2.04
PRPF31Q8WWY3 MEX3D-201ENST00000402693 2850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 ADAP1-201ENST00000265846 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 AC060814.1-201ENST00000554326 538 ntBASIC27.76■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 DPF1-202ENST00000412732 2303 ntTSL 1 (best) BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 PMS1-220ENST00000618056 1468 ntTSL 5 BASIC27.75■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 RARRES2P2-201ENST00000394842 485 ntBASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC27.74■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 MAF-201ENST00000326043 2646 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 CTSZ-201ENST00000217131 1495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC27.73■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 BMP8A-201ENST00000331593 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 COMMD7-201ENST00000278980 1900 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC27.72■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 TPI1-201ENST00000229270 1763 ntTSL 1 (best) BASIC27.71■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 PROC-203ENST00000409048 1586 ntTSL 5 BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.7■■■□□ 2.03
PRPF31Q8WWY3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 DRD5P2-201ENST00000421395 2012 ntBASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 THAP11-201ENST00000303596 2114 ntAPPRIS P1 BASIC27.7■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 TESK1-201ENST00000336395 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
PRPF31Q8WWY3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.69■■■□□ 2.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10.3 ms