Protein–RNA interactions for Protein: Q8WWH5

TRUB1, Probable tRNA pseudouridine synthase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 349 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRUB1Q8WWH5 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 CHPT1-201ENST00000229266 1585 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 AUTS2-202ENST00000403018 957 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 ATP6V1E2-204ENST00000522587 1559 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
TRUB1Q8WWH5 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 DENR-202ENST00000455982 1052 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 AC012615.2-201ENST00000586259 447 ntTSL 4 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 LCNL1-201ENST00000408973 1839 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 CIB2-201ENST00000258930 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 NPC2-207ENST00000555619 1035 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 DLK2-201ENST00000357338 2038 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
TRUB1Q8WWH5 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 AP002884.3-203ENST00000419895 1711 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 ADNP-AS1-201ENST00000558899 927 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 QDPR-201ENST00000281243 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 BARX1-201ENST00000253968 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
TRUB1Q8WWH5 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 IRAK1-205ENST00000429936 2127 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 MEST-211ENST00000437945 1455 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 SCX-201ENST00000567180 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 SETD8P1-201ENST00000623146 1180 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 RARRES2P7-201ENST00000567349 469 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
TRUB1Q8WWH5 RAPGEF1-203ENST00000372195 6256 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
TRUB1Q8WWH5 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.9 ms