Protein–RNA interactions for Protein: Q8WW22

DNAJA4, DnaJ homolog subfamily A member 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 397 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNAJA4Q8WW22 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 AC021231.2-201ENST00000594613 730 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 C2orf88-204ENST00000409870 1441 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 CYB5R3-201ENST00000352397 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 CCDC149-203ENST00000502801 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 IFFO2-203ENST00000455833 6188 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
DNAJA4Q8WW22 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 ZNF639-209ENST00000496856 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 SHF-207ENST00000560540 2062 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 RAB40C-204ENST00000538492 2569 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 MRPL9-201ENST00000368829 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 AL589765.4-201ENST00000512280 382 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 ARTN-203ENST00000414809 1943 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 RPS2P35-201ENST00000443417 897 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 ACAA1-220ENST00000627515 1862 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 TLE6-201ENST00000246112 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 CPNE1-202ENST00000352393 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 CTSA-203ENST00000372459 1972 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
DNAJA4Q8WW22 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 NME2-202ENST00000393190 866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 TXNL4A-208ENST00000588162 752 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 AC110285.7-201ENST00000624417 1536 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 C14orf80-203ENST00000354560 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 NR6A1-203ENST00000416460 1898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 UCK1-204ENST00000372215 2167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 CHSY1-201ENST00000254190 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
DNAJA4Q8WW22 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 PABPC1L2B-AS1-201ENST00000416989 1167 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 AL662864.1-201ENST00000454388 1167 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 ESRRA-203ENST00000406310 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 TAZ-201ENST00000369776 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 REPIN1-204ENST00000466559 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 TAZ-213ENST00000601016 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 SLC9A3R2-201ENST00000424542 2194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
DNAJA4Q8WW22 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms