Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 ITGA9-203ENST00000422441 2282 ntTSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 CADPS-215ENST00000490353 2669 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 C11orf80-218ENST00000540737 1786 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.06■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 GPR75-ASB3-201ENST00000406625 2113 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 SMARCD3-203ENST00000392811 2018 ntTSL 1 (best) BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 HLA-V-202ENST00000446817 847 ntBASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 NSMCE4A-201ENST00000369017 1224 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC29.04■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 S1PR4-201ENST00000246115 1565 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 PURG-201ENST00000339382 2693 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 MTCH1-201ENST00000373616 2006 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 METRNL-202ENST00000570778 967 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 CAPNS1-211ENST00000590874 926 ntTSL 5 BASIC29.02■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC29.01■■■□□ 2.24
CCDC12Q8WUD4 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC12Q8WUD4 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC12Q8WUD4 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
CCDC12Q8WUD4 TRADD-201ENST00000345057 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC12Q8WUD4 MBP-237ENST00000579129 1052 ntTSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC12Q8WUD4 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29■■■□□ 2.23
CCDC12Q8WUD4 BMP7-204ENST00000450594 1857 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
CCDC12Q8WUD4 DTNBP1-212ENST00000622898 1305 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC12Q8WUD4 JAG2-201ENST00000331782 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC12Q8WUD4 TSPOAP1-AS1-203ENST00000579527 2042 ntTSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC12Q8WUD4 ABHD17C-202ENST00000558464 1976 ntTSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
CCDC12Q8WUD4 CLTA-207ENST00000470744 1102 ntTSL 2 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC12Q8WUD4 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC12Q8WUD4 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC12Q8WUD4 C17orf97-201ENST00000360127 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
CCDC12Q8WUD4 ARL6IP4-211ENST00000454885 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC12Q8WUD4 TMEM9-201ENST00000367330 1959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC12Q8WUD4 SERPING1-205ENST00000403558 2231 ntTSL 5 BASIC28.96■■■□□ 2.23
CCDC12Q8WUD4 RAB40C-201ENST00000248139 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC12Q8WUD4 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC28.95■■■□□ 2.23
CCDC12Q8WUD4 SENP3-201ENST00000321337 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
CCDC12Q8WUD4 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC12Q8WUD4 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC12Q8WUD4 EMID1-203ENST00000404820 2118 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC12Q8WUD4 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC12Q8WUD4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
CCDC12Q8WUD4 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC12Q8WUD4 AC073111.5-206ENST00000642087 859 ntAPPRIS P1 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC12Q8WUD4 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC12Q8WUD4 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
CCDC12Q8WUD4 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
CCDC12Q8WUD4 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC12Q8WUD4 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC12Q8WUD4 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
CCDC12Q8WUD4 SETBP1-202ENST00000426838 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC12Q8WUD4 LINC01003-201ENST00000564834 1764 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC12Q8WUD4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC12Q8WUD4 VEGFA-208ENST00000417285 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
CCDC12Q8WUD4 AL121987.2-201ENST00000418602 1578 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC12Q8WUD4 MIR4449-201ENST00000578365 66 ntBASIC28.89■■■□□ 2.22
CCDC12Q8WUD4 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC12Q8WUD4 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC28.89■■■□□ 2.21
CCDC12Q8WUD4 RPS20-211ENST00000524349 752 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC12Q8WUD4 BX255925.1-201ENST00000566954 1854 ntBASIC28.88■■■□□ 2.21
CCDC12Q8WUD4 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC12Q8WUD4 UBA52-204ENST00000595158 743 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC12Q8WUD4 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
CCDC12Q8WUD4 AC009041.3-201ENST00000564390 879 ntTSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
CCDC12Q8WUD4 FAAH-201ENST00000243167 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC12Q8WUD4 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC12Q8WUD4 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
CCDC12Q8WUD4 SHOX2-201ENST00000389589 2072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC12Q8WUD4 WTAP-206ENST00000621533 2109 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC12Q8WUD4 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC12Q8WUD4 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC12Q8WUD4 MAPKAPK2-201ENST00000294981 2171 ntTSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
CCDC12Q8WUD4 BOK-AS1-201ENST00000434306 643 ntTSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC12Q8WUD4 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.83■■■□□ 2.21
CCDC12Q8WUD4 VEGFA-202ENST00000324450 954 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 VEGFA-203ENST00000372055 1286 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 VEGFA-213ENST00000482630 1146 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 VEGFA-227ENST00000615393 984 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 VEGFA-228ENST00000617771 1116 ntTSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 VEGFA-229ENST00000621747 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 VEGFA-230ENST00000640482 1065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 VEGFA-232ENST00000640653 1170 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 TCF24-201ENST00000563496 2450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.82■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 REXO4-201ENST00000371935 1899 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
CCDC12Q8WUD4 HYAL2-202ENST00000395139 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.3 ms