Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUA8

TSKU, Tsukushin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TSKUQ8WUA8 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 NKX1-1-201ENST00000422806 1236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 MSX2-202ENST00000507785 1188 ntTSL 2 BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 AL031258.1-201ENST00000623562 325 ntBASIC18.88■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 CDKN2D-202ENST00000393599 1422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 LINC00588-201ENST00000521663 1875 ntTSL 2 BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 TOMM40-201ENST00000252487 1707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 TOMM40-202ENST00000405636 1709 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 ABHD17C-201ENST00000258884 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
TSKUQ8WUA8 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 UBE2L6-201ENST00000287156 1354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 CRIM1-201ENST00000280527 5912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 GBX2-201ENST00000306318 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 ZNRF2P1-201ENST00000441407 443 ntBASIC18.81■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 MYLIP-202ENST00000356840 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 AC127502.1-201ENST00000399971 1502 ntBASIC18.8■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 C1QTNF8-201ENST00000328449 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.8■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 AP001107.7-201ENST00000533287 272 ntTSL 2 BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 TOP2B-204ENST00000435706 5389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 C16orf72-201ENST00000327827 5953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC18.78■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 ANO1-202ENST00000355303 4790 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.6
TSKUQ8WUA8 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.77■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 RNF19B-203ENST00000373456 2560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC18.76■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC18.75■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 TP53I13-201ENST00000301057 1530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 UBAC1-201ENST00000371756 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 AC009690.3-201ENST00000569547 1902 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 BATF3-201ENST00000243440 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 KCNC3-201ENST00000376959 5447 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 ACSF2-203ENST00000502667 2098 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 STUB1-201ENST00000219548 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 EBAG9-202ENST00000395785 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
TSKUQ8WUA8 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 AC068152.1-207ENST00000573341 647 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 LYPLA1-215ENST00000618914 2482 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 SLC16A11-202ENST00000447225 1779 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 THRA-202ENST00000394121 2260 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 NKX2-3-201ENST00000344586 2097 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
TSKUQ8WUA8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms